內容簡介
本書全面繫統地介紹了進化算法在生物多序列比對中的應用,根據內容的分類,分為“多序列比對基礎篇”“多序列比對模擬篇”和“多序列比對參數篇”三個模塊。首先介紹生物多序列比對的基礎知識,包括多序列比對的基本概念、原理、方法、常用數據庫、常用工具和應用等內容,並介紹進化算法和很優化理論的基礎知識,以及遺傳算法、粒子群優化算法和量子粒子群優化算法的優化過程及收斂性分析,為進行多序列比對的模擬提供理論基礎;然後詳細介紹各進化算法模擬多序列比對的過程與結果;很後對於多序列比對很重要的目標函數參數進行建模與分析。本書具有繫統性強、可讀性強、可操作性強等特點。
●上篇多序列比對基礎篇
●第1章生物多序列比對3
●1.1生物信息學3
●1.1.1生物信息學的起源3
●1.1.2生物信息學的概念4
●1.1.3生物信息學的主要研究內容4
●1.2序列比對的概念及其發展歷史8
●1.2.1序列比對的提出與基本概念8
●1.2.2序列比對的目的和意義8
●1.2.3國內外研究現狀10
●1.2.4多序列比對面臨的挑戰10
●1.3多序列比對的基本原理11
●1.3.1多序列比對的相關概念11
●1.3.2序列比對的分類12
●1.3.3多序列比對的數學定義13
●1.3.4多序列比對的打分方法14
●1.4多序列比對方法22
●1.4.1比對方法22
●1.4.2多序列比對算法23
●1.5多序列比對常用數據庫33......