●部分 法規及配套規章
農業轉基因生物安全管理條例(2001年5月23日中華人民共和國國務院令第304號發布，2011年1月8日、2017年10月7日修訂)
農業轉基因生物安全評價管理辦法(2002年1月5日農業部令第8號公布2004年7月1日、2016年7月25日、2017年11月30日修訂)
農業轉基因生物進口安全管理辦法(2002年1月5日農業部令第9號公布2004年7月1日、2017年11月30日修訂)
農業轉基因生物標識管理辦法(2002年1月5日農業部令0號公布2004年7月1日、2017年11月30日修訂)
農業轉基因生物加工審批辦法(2006年1月16日農業部第3次常務會議審議通過)
進出境轉基因產品檢驗檢疫管理辦法(2001年9月5日國家質量監督檢驗檢疫總局局務會議審議通過)
第二部分 規範性和其他重要文件
一、行政審批
國務院關於第三批取消中央指定地方實施行政許可事項的決定(國發[2017]7號)
國務院關於第三批清理規範國務院部門行政審批中介服務事項的決定(國發[2017]8號)
國務院關於批清理規範89項國務院部門行政審批中介服務事項的決定(國發[2015]58號)
國務院關於第五批取消和下放管理層級行政審批項目的決定(國發[2010]21號)
國務院審改辦關於取消行政許可事項子項的說明(審改辦函[2015]89號)
農業部辦公廳關於印發《農業部科教(轉基因)行政審批工作規範》的通知(農辦科[2013]14號)
中華人民共和國農業部公告第2147號(實施農業轉基因生物行政審批在線申請)
中華人民共和國農業部公告第2436號(轉基因棉花種子生產經營許可規定)
二、機構職能
國務院辦公廳關於同意農業轉基因生物安全管理部際聯席會議制度的函(國辦函[2007]106號)
關於成立農業部農業轉基因生物安全管理領導小組和農業轉基因生物安全管理辦公室的通知(農人發[2002]6號)
關於印發《農業轉基因生物安全管理職責分工意見》的通知(農辦人(2001]83號)
農業部辦公廳關於科技教育司(外來物種管理辦公室)職能調整的通知(農辦人[2011]60號)
三、監管和科普
農業部辦公廳關於印發《2018年農業轉基因生物監管工作方案》的通知(農辦科[2018]2號)
農業部關於進一步加強農業轉基因生物安全監管工作的通知(農科教發[2014]2號)
農業部關於進一步加強轉基因作物監管工作的通知(農科教發[2016]3號)
關於開展批農業轉基因生物試驗基地認定工作的通知[農科(執法)函[2016]第397號
關於指導做好涉轉基因廣告管理工作的通知[農科(執法)函[20158號
農業部辦公廳關於開展轉基因知識集中宣傳培訓工作的通知(農辦科[2014]41號)
農業部辦公廳關於加強農業轉基因科普宣傳工作的通知(農辦科[2011]4號)
四、安全評價
國務院法制辦公室對農業部《關於商請對(農業轉基因生物安全管理條例有關問題進行解釋的函》的答復(國法函[2002]19號)
農業部辦公廳關於印發《農業轉基因生物安全委員會工作規則》的通知(農辦科[2013]33號)
農業部關於印發《第五屆農業轉基因生物安全委員會組成人員名單》的通知(農科教發[2016]4號)
農業部辦公廳關於印發《農業轉基因生物(植物、動物、動物用微生物)安全評價指南》的通知(農辦科[2017]5號)
中華人民共和國農業部公告693號(轉基因抗蟲棉安全評價檢測和安全證書申請程序)
中華人民共和國農業部公告1643號(轉基因棉花種子生產經營許可規定)
五、標準和檢測
農業部關於組建全國農業轉基因生物安全管理標準化技術委員會的通知(農質發[2017]8號)
農業轉基因生物安全標準化體繫規劃(2015―2019)(農科管理函[2015]29號)
關於提交轉基因活性樣品和相關材料有關要求的通知[農科(執法)函[2013]第44號
關於印發《轉基因植物及其產品成分檢測――轉化體特異性和基因特異性定性PCR方法標準文本驗證方案》的通知(農基安標[2012]1號)
農業部關於印發《農業轉基因生物安全監督檢驗測試機構基本條件》的通知(農市發[2006]19號)
農業轉基因生物標簽的標識(農業部869號公告一1―2007)
農業部發布轉基因標準彙總情況表[已發布標準清單(現行有效176項)
第三部分 相關法律、法規和規章
中華人民共和國行政許可法(2003年8月27日中華人民共和國主席令第7號公布)
中華人民共和國行政處罰法(2017年9月1日中華人民共和國主席令第76號公布)
中華人民共和國行政強制法(2011年6月30日中華人民共和國主席令第49號公布)
中華人民共和國食品安全法(2015年4月24日中華人民共和國主席令第21號公布)
中華人民共和國農產品質量安全法(2006年4月29日中華人民共和國主席令第49號公布)
中華人民共和國種子法(2015年11月4日中華人民共和國主席令第35號公布)
中華人民共和國畜牧法(2015年4月24日中華人民共和國主席令第26號公布)
中華人民共和國進出境動植物檢疫法(1999年10月30日中華人民共和國主席令第53號公布)
中華人民共和國進出口商品檢驗法(2013年6月29日中華人民共和國主席令第5號公布)
中華人民共和國政府信息公開條例(2007年4月5日中華人民共和國國務院令第492號發布)
指導外商投資方向規定(2002年2月11日中華人民共和國國務院令第346號發布)
外商投資產業指導目錄(2017年修訂)(2017年7月28日國家發展和改革委員會、商務部令第4號發布)
農藥管理條例(2017年3月16日中華人民共和國國務院令第677號修訂)
獸藥管理條例(2016年2月6日中華人民共和國國務院令第666號修訂)
飼料和飼料添加劑管理條例(2017年3月1日中華人民共和國國務院令第676號修訂)
病原微生物實驗室生物安全管理條例(2016年2月6日中華人民共和國國務院令第666號修訂)
實驗動物管理條例(2017年3月1日中華人民共和國國務院令第676號修訂)
農業植物品種命名規定(2012年3月24日農業部令第2號發布)
主要農作物品種審定辦法(2016年7月8日農業部令第4號發布)
農作物種子生產經營許可管理辦法(2016年7月8日農業部令第5號發布)
獸藥注冊辦法(2004．年11月15日農業部令第44號發布)
肥料登記管理辦法(2017年12月1日農業部令第8號發布)
開展林木轉基因工程活動審批管理辦法(2017年12月26日國家林業局局務會議修訂通過並公布)
中華人民共和國畜禽遺傳資源進出境和對外合作研究利用審批辦法(2008年8月20日國務院第23次常務會議通過)
出入境人員攜帶物檢疫管理辦法(2012年6月27日國家質量監督檢驗檢疫總局局務會議審議通過)
新食品原料安全性審查管理辦法(2013年2月5日經原衛生部部務會審議通過)
水生生物增殖放流管理規定(2009年3月20日農業部第4次常務會議審議通過)