蘇州博物館圖書館所藏中文古籍有10萬餘冊（含卷軸、冊頁等），雖不雲多，然可日精善，尤其是佛教經卷、地方文獻、碑帖拓片、名人手稿等，均為極富特色的館藏佳品。自2007年開展全國古籍普查始，蘇州博物館迄今已有56種古籍入選全國珍貴古籍名錄，127種入選江蘇省珍貴古籍名錄，其中不乏歷史文獻性、學術資料性、藝術代表性俱佳的珍品。
《蘇州博物館藏古籍善本》收錄了：妙法蓮華經七卷，佛說天地八陽經，佛說阿彌陀經，雜阿含經五十卷，金光明經四卷金光明經懺悔滅罪傳等珍品。

1 妙法蓮華經七卷
2 佛說天地八陽經
3 佛說阿彌陀經
4 雜阿含經五十卷
5 金光明經四卷金光明經懺悔滅罪傳
6 大隋求陀羅尼神咒經一卷
7 大隋求陀羅尼神咒經一卷（梵文）
8 佛說相輪陀羅尼經一卷
9 佛說相輪陀羅尼經一卷
10 金剛般若波羅蜜經
11 般若波羅蜜多心經
12 佛說觀世音經
13 妙法蓮華經七卷
14 大般若波羅蜜多經六百卷
15 大般若波羅蜜多經六百卷
16 大方廣佛華嚴經疏一百二十卷
17 纂圖互注揚子法言十卷
18 東萊呂太史文集十五卷別集十六卷外集五卷麗澤論說集錄十卷附錄三卷附錄抬遺一卷
19 詩集傳十卷
20 增刊校正王狀元集注分類東坡先生詩二十五卷
21 古樂府十卷
22 樂府詩集一百卷目錄二卷
23 天文秘略說不分卷
24 選詩補注八卷補遺二卷續編四卷
25 中說十卷
26 纂圖互注苟子二十卷
27 上清靈寶濟度大成金書四十卷
28 禮記集說十六卷
29 資治通鋻綱目五十九卷
30 十四經發揮三卷
31 晦庵先生五言詩抄一卷晦庵文抄七卷
32 琵琶記三卷新鐫伯喈釋義大全一卷
33 唐詩品彙九十卷拾遺十卷
34 資治通鋻綱目五十九卷首一卷
35 續資治通鋻綱目二十七卷
36 震澤編八卷
37 [弘治]昆山志十四卷
38 [正德]姑蘇志六十卷
39 匏翁家藏集七十七卷補遺一卷
40 [正德]興寧志四卷
41 東萊先生五代史詳節十卷
42 陽山顧氏文房小說四十種五十八卷
43 六書正訛五卷
44 史記一百三十卷
45 金薤琳瑯二十卷
46 荊川先生批點精選漢書六卷
47 劉須溪先生記鈔八卷
48 呂氏春秋二十六卷
49 後漢書九十卷志三十卷
50 資治通鋻綱目五十九卷首一卷
51 東垣十書十九卷
52 新纂門目五臣音注揚子法言十卷
53 中說十卷
54 廣文選六十卷
55 楚辭集注八卷辯證二卷後語六卷
56 白氏文集七十一卷
57 顧氏明朝四十家小說四十種四十三卷
58 玉臺新詠十卷續玉臺新詠五卷
59 古今說海一百三十五種一百四十二卷
60 何氏語林三十卷
61 古今合璧事類備要前集六十九卷後集八十一卷續集五十六卷別集九十四卷外集六十六卷
62 楊升庵輯要三種十二卷
63 周禮傳五卷翼傳二卷圖說二卷
64 五嶽山人集三十八卷
65 西山先生真文忠公文章正宗二十四卷
66 河嶽英靈集三卷
67 晉二俊文集二種二十卷
68 周禮十二卷
69 六子書六十卷
70 儀禮注疏十七卷
71 駱賓王集二卷
72 百家類纂四十卷
73 呂氏春秋二十六卷
74 南豐先生元豐類稿五十卷續附一卷
75 楚辭十七卷疑字直音補一卷
76 五運六氣不分卷
77 松籌堂集十二卷
78 大佛頂如來密因修證了義諸菩薩萬行首愣嚴經十卷
79 孔叢子三卷
80 南華經十六卷
81 方氏墨譜六卷
82 尺牘清裁六十卷補遺一卷
83 國史經籍志六卷
84 韋蘇州集十卷拾遺一卷
85 漢書評林一百卷
86 蘇黃題跋二種十二卷
87 十六國春秋一百卷
88 石田先生集十一卷
89 孫子參同五卷
90 東坡文選二十卷
91 解莊十二卷
92 周禮注疏四十二卷
93 群芳清玩十二種十六卷
94 倪雲林一卷附題畫詩一卷
95 史記一百三十卷
96 史記一百三十卷
97 三國志六十五卷
98 文選六十卷
99 陶淵明全集四卷
100 甲申紀事十三卷
101 湯文正公文稿不分卷
102 筆夢不分卷
103 過墟志感二卷
104 山海經十八卷
105 御定歷代題畫詩類一百二十卷
106 劉禹錫中唐詩不分卷
107 圭美堂集二十六卷
108 說文解字十五卷
109 六一居士全集錄二卷
110 周易古義不分卷
111 瓜涇徐氏家乘十卷
112 長吟閣詩集八卷
113 石朱批諭旨三百六十卷
114 息舫合刻不分卷
115 林外野言二卷
116 墨子十六卷
117 舊五代史一百五十卷目錄二卷
118 王鐵夫先生山遊詩口口卷
119 詩冊不分卷
120 論語集解義疏十卷
121 論語集解義疏十卷
122 張廷濟日記不分卷
123 說文新附考不分卷
124 梧溪集七卷
125 錦裡耆舊傳八卷
126 遊志續編一卷
127 吳郡文編二百四十六卷
128 潘世恩日記不分卷
129 思補堂文鈔一卷
130 思補堂詩稿一卷雜錄一卷
131 有真意齋詩集不分卷
132 消暑隨筆一卷
133 讀史隨筆不分卷
134 東坡詩話不分卷
135 丙午使滇日記一卷癸丑鎖闈日記一卷鎖闈偶記一卷
136 蓼莪餘詠一卷小鷗波館文鈔不分卷小鷗波館文集不分卷
137 小鷗波館詩鈔十五卷
138 小鷗波館詞鈔口卷歲可年譜不分卷花間笛譜一卷
139 小鷗波館隨筆一卷
140 西清偶筆一卷讀史雜鈔一卷
141 潘曾綬日記不分卷
142 香禪日記不分卷
143 百不如人室詩草不分卷文草不分卷詞草不分卷
144 潘譜琴日記不分卷
145 竹山隨筆不分卷
146 操縵堂詩口卷
147 復莊今樂府選不分卷
148 西算新法直解八卷
149 烯血叢鈔四卷
150 周禮補疏十二卷
151 潘祖蔭日記不分卷
152 洪鈞日記不分卷
153 潘觀保日記不分卷
154 經籍異文考三十卷
155 經籍異文考三十卷經籍異文一卷一
156 吳蔭培日記不分卷
157 藏書紀事詩殘帙不分卷
158 寒山寺志三卷
159 懷古堂詩選十二卷
160 懷古堂詩選二卷遊黃山記一卷
《蘇州博物館藏古籍善本》四部索引