宋建主編的《志丹苑：上海元代水閘遺址研究文集》共有19篇文章，大部分已經在書刊上發表，少數為新作。根據文章內容將本文集分為四個部分。**部分為“發現”，有7篇文章，涵蓋自2001年5月獲得遺址的*初線索開始至2012年的第三次發掘，歷時12年的水閘遺址發現歷程。第二部分為“論證”，有4篇文章，是水閘遺址學術價值與文化底蘊的發掘。2001年和2006年分別召開兩次專家論證會，前次論證會為考古發掘的順利實施奠定了科學基礎。後次論證會召開於全面了解水閘遺址的基本結構之後，完整地總結了考古發掘的水平和成就，論證了遺址在中國水利工程發展史和上海地方史研究方面的科學價值與學術意義。第三部分為“保護”，有2篇文章，內容分別為水閘遺址整體結構的保護和不同材質文物遺存的保護。第四部分為“研究”，有6篇文章，是運用多學科方法和技術手段，專題研究水閘遺址的相關課題，重點是建造水閘的環境背景、建造技術和使用水閘的工作原理。

前言／宋建
2006年度全國十大考古新發現
發現
綜合物理探查在上海元代水閘遺址考古中應用／牟建華
志丹苑石構水工建築遺址的發現／志丹苑考古隊
志丹苑水閘遺址的考古發掘與研究／志丹苑考古隊
上海市普陀區志丹苑元代水閘遺址發掘簡報／上海博物館考古研究部
2012年志丹苑水閘遺址考古發掘主要收獲／上海博物館考古研究部
志丹苑水閘遺址發現記／王蓮芬
志丹苑元代水閘揭秘／宋建
論證
志丹苑遺址2001年專家論證會紀要
志丹苑遺址2006年專家論證會紀要
志丹苑遺址2006年專家論證會論證意見
關於志丹苑元代水閘遺址的發掘與保護——徐蘋芳在2006年專家論證會上的發言
保護
上海志丹苑元代水閘遺址防護工程的實施／歐永康
上海志丹苑元代水閘遺址文物保護技術思路探討／周浩 吳來明 解玉林 徐方圓
研究
志丹苑元代水閘遺址與元水利專家任仁發／何繼英
上海志丹苑遺址元代水閘的技術解析／陳傑 陳靜
上海志丹苑遺址元代水閘的再現及古河道演變／張玉蘭 宋建 趙泉鴻
上海志丹苑元代水閘遺址的發現及其古環境／張玉蘭 宋建 賈麗
上海志丹苑埋藏元代水閘興廢因素探討／王昕 王張華 陳中原 何繼英 宋建
志丹苑出土的鐵錠榫／周祥
志丹苑考古大事記