本書在《水處理微生物學基礎與技術應用》（第一版）的基礎上修改編寫，對上一版的章節進行了重新梳理，增加了新的內容並在每章後面增加了思考題。全書分3篇，共16章，第1篇為水處理生物學基礎，包括：緒論、病毒與亞病毒、原核微生物、真核微生物、大型水生植物與水體的生態修復、微生物的營養與代謝、微生物的生長與水微生物生態、微生物的遺傳變異與基因工程；第2篇為水處理工藝的生物學原理與技術應用，包括：好氧水處理工藝的生物學原理、厭氧水處理工藝的生物學原理、生物脫氮除磷工藝原理與技術應用、水的衛生細菌學及水中微生物的控制；第3篇為水處理生物學實驗與檢測技術，包括：微生物的觀察與分析、微生物的純種分離與培養、水環境中微生物的檢測、現代分子生物學技術。

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