《證據科學論綱》旨在探索證據科學的理論體繫及其應用問題。第一章論述了證據科學的學科性質和範圍。
第二章探討了證據理論問題：事實與證據的特性及其關繫。事實作為證據科學的邏輯起點，包含著事實認定中各種問題的胚芽，其固有特性特別是經驗性之歷史展開，則塑造了證據的基本屬性，也決定了事實認定必然是一個經驗推論過程。
第三章考察了證據科學發展的歷史過程，揭示了傳統證據理論形成、發展與成熟的過程，以及當代證據法教義學的思想源流和特征。
第四章證據概率論，闡釋了證明過程的概率論路概率解釋為科學證明提供了可供選擇的概念基礎與方法。
第五章證據推理論，探討了證據推理的含義、性質與功能。證據推理本質上是尋求事實真相的好解釋推論活動，包含著價值考量，其結果具有可錯性，其功能在於實現從證據到證成的轉變。證據推理方法，包括圖示法、敘事法、論證與故事的混合法。證據推理在實踐中面臨著科技挑戰、價值權衡、方法的局限性、結果的可接受性等問題。
第六章證據決策論，論述了決策活動運用證據發現事實真相的基本原理，重點介紹了訴訟證據裁判中的博弈和博弈模型，分析了訴訟證據決策涉及的事實、證據、法律、訴訟主張等影響因素，特別是證據對待證事實的支持度（可以被解釋為裁判者的主觀確信），以及使用量化模型進行證據評價等問題。
第七章證據評價論，以決策活動為坐標，討論了一般語境和法律語境中的證據評價問題。在應然層面，現代司法的“理性主義傳統”對實現司法公正具有核心意義。
第八章證據敘事論，通過敘事學一般理論的回顧，討論了敘事學跨學科發展的趨勢以及由此引發的證據科學“敘事轉向”。
第九章證據解釋論，首先從解釋學的視角，分析了司法裁判中事實、證據與解釋的關繫。然後，探討了好解釋推理適用於司法裁判事實認定過程的應然性和可操作性。最後，以承認訴訟事實認定是好解釋推理過程為前提，提出應以似真性理念來構建我國司法裁判事實認定的接受標準（即證明標準）。
第十章科學證據論，首先從科學知識、科學方法、科學發現、科學證明等方面，探討了證據在科學認識中的作用。接著，討論了科學證據對司法事實認定的作用。最後，探討了科學證據在司法證明活動中的生成和運用。作為科學證據采納標準的多伯特案裁決，存在著混淆“可靠性”和“科學性”問題，因此需要重構。科學證據可采性的內部標準包括相關性、科學有效性和可靠性；外部標準主要是指專家可信性。
