近二十餘年來，儒學研究已呈現國際化發展趨向，開闢出“東亞儒學”這一新研究領域。《東亞儒學問題新探》緊扣“儒學”“東亞”“日本化”這三個關鍵詞，對東亞儒學、日本儒學以及儒學日本化等歷史問題、理論問題進行了深入探討。
本書分為三個部分：一部分是有關“東亞”問題的討論，對“東亞”“東亞儒學”概念的發生歷史以及演變歷程，乃至晚近“東亞”論述中的復雜面向，進行了全面仔細的介紹和探討，反映了前沿的發展成果以及作者的獨到見解。第二部分深入德川日本儒學的歷史內部，對“儒學日本化”具有典型意義的徂徠學、仁齋學的思想展開了富有創見的研究，同時，對日本獨特的心學思想——石門心學及其講學運動中的“中國因素”等問題進行了仔細的考察，這些研究既吸收了日本學界已有的成果，又具有中國學者的比較視野。第三部分是對現代以來日本學界有關“日本性”問題的探討，主要透過丸山後期的日本文化研究，在充分肯定丸山思想有關“日本性”問題的思考具有重要學術意義的同時，深度反思了丸山後期提出的“古層—原型”論（又稱“執拗低音”論）的史學觀點。
