縱觀全書，馬派中醫學術思想可以概括為以下十個方面：
1. 防、治、養三結合的治未病與治已病思想。
2. 以“常體、寒體、熱體、特敏體”為綱的中醫體質新論。
3. 以“整體觀念、天人合一；辨證論治、個體診療；治未病、防為先；治養結合、貫穿始終”為核心的中醫四大特色論。
4. 突出問診、結合現代影像及實驗室檢查的“問望聞切查”中醫五診法。
5. 以“衛護心神、順時調神、養生養德、形神兼養、動靜相宜、節欲守神”為特色的中醫心理衛生論。
6. 以“傳承創新和傳播普及”為己任的中醫科研科普並重論。
7. 以“心胸有量、動靜有度、飲食有節、起居有常”為代表的中醫養生四字論。
8. 圍繞臨床證治經驗總結及辨治思路探討的中醫思維方法。
9. 以“三大戰略八大戰術”為導向的中醫傳承發展觀。
10. 以“衷中是基、衷中參西”提高臨床療效為目標的鋼杆中醫成纔論。
