●風溫/1
●溫疫/6
●暑溫/32
●伏暑/41
●溫毒/52
●濕溫/57
●鼕溫/61
●中風/63
●少陽瘈疭/64
●肝風/65
●肝厥/68
●脅痛/71
●肝癰/77
●癲狂/79
●虛勞/86
●吐血/91
●便血/98
●腫脹/102
●單腹脹/109
●滯下/111
●部分目錄

《吳鞠通醫案》繫後人根據以抄本形式流傳的吳鞠通生前醫案整理而成。1916年，有兩種《吳鞠通醫案》問世，其一為金月笙所輯，由杭州有益山房鉛印；其二為裘吉生所輯，由紹興醫藥學報社用木活字印行。本書所選用的，是金月笙所輯的杭州有益山房鉛印本。
《吳鞠通醫案》文風簡約清朗，極少見繁瑣枝蔓之議論，多數醫案以敘為主，部分醫案夾敘夾議，但論說簡明，直扼病機；個別醫案以論為主，對病因病機及治法用藥多所闡發。