●第1章 大數據的來源
1.1 大數據的概念及類型
1.1.1 生物學和醫學大數據
1.1.2 農業大數據
1.2 人類基因組計劃
1.2.1 DNA雙螺旋的魔力
1.2.2 解碼“生命天書”
1.3 大數據對生命科學的影響
1.3.1 生物信息學的概念
1.3.2 生物信息學的誕生和發展
1.3.3 信息資源與生命科學研究
1.3.4 計算機時代的生物學
1.4 了解基因組數據庫和生物信息學
1.4.1 生物信息學研究的主要推動力
1.4.2 特定基因組資源
1.4.3 疾病基因組資源
1.4.4 DNA序列分析
1.4.5 尋找序列之間的差異
1.4.6 多序列比對
1.4.7 二次數據庫搜索
1.4.8 常見的生物信息學分析軟件
第2章 生物醫學的變革
2.1 個體基因組時代即將來臨
2.1.1 尋找人類遺傳疾病的根源
2.1.2 全基因組關聯研究及存在的問題
2.1.3 eQTL作圖
2.1.4 挑戰與策略
2.2 個性化醫學
2.2.1 個體遺傳差異
2.2.2 個性化醫學的意義
2.2.3 如何實現個性化醫療服務
2.3 大數據將顛覆傳統醫學
2.3.1 傳統醫學模式的弊端
2.3.2 醫患關繫
2.3.3 醫學互聯網的出現
2.3.4 移動醫療
2.3.5 顛覆傳統醫學
第3章 大數據對制藥公司的影響
3.1 藥靶的篩選
3.1.1 藥物基因組學
3.1.2 大數據如何給藥物研發帶來新革命
3.1.3 未來的場景
3.2 藥物的個體差異
3.3 基於大數據的藥物設計
3.3.1 計算機輔助藥物設計
3.3.2 計算機輔助疫苗設計
3.3.3 藥物研發的大數據處方
3.3.4 大數據轉變面臨的挑戰
第4章 大數據引發農業的變革
4.1 何為農業大數據
4.2 大數據對農業的影響
4.2.1 種質創新
4.2.2 精準農業
4.2.3 食物追蹤
4.2.4 對供應鏈的影響
4.3 如何利用農業大數據
4.4 大數據與遺傳育種
4.4.1 基因組輔助育種技術
4.4.2 作物基因組與遺傳改良
4.4.3 經濟動物基因組及遺傳改良
4.5 農業信息管理
4.5.1 作物品種資源數據庫
4.5.2 動物遺傳資源數據庫
4.5.3 農業有害生物數據庫
4.6 智能化管理農場網絡
4.6.1 智能化農業生產管理
4.6.2 農產品物流信息管理
4.6.3 農產品信息回溯
4.7 結合中國國情,促進精細農業與大數據融合
4.8 農業大數據的美好未來
第5章 大數據時代的倫理隱憂
5.1 基因組信息涉及的倫理隱私
5.1.1 倫理學問題
5.1.2 基因信息與身份識別
5.1.3 基因信息可能暴露意外的親緣關繫
5.1.4 基因信息可用於推測個人特征
5.1.5 基因信息可能導致基因歧視
5.1.6 基因信息可能導致保險公司歧視性定價策略
5.2 什麼類型的基因檢測更容易存在倫理隱患?
5.2.1 單基因檢測
5.2.2 疾病的基因檢測
5.2.3 全外顯子、全基因組檢測或檢測位點非常多的芯片檢測
5.2.4 親子鋻定、司法鋻定
5.3 如何注意避免洩露基因隱私
5.3.1 了解檢測目的
5.3.2 閱讀知情同意書和條款,保護自身權利
5.3.3 了解檢測所使用的技術手段
5.4 大數據時代生命倫理展現價值維度
5.4.1 生命倫理學的出現及其研究範疇
5.4.2 生命倫理學原則
5.4.3 大數據時代的醫學倫理與信息安全
主要參考文獻