●前言
第一章 外來物種紅耳龜入侵概述 1
第一節 紅耳龜形態、分類及地理分布 2
一、紅耳龜的形態特征 2
二、紅耳龜的分類地位 2
三、紅耳龜的地理分布及入侵現狀 2
第二節 紅耳龜在中國的入侵現狀 3
一、紅耳龜在中國的分布 3
二、紅耳龜的傳入及擴散路徑 4
第三節 紅耳龜種群建立及傳播機制 6
一、紅耳龜的種群結構 6
二、紅耳龜的生態適應性 7
三、紅耳龜的天敵 13
第四節 紅耳龜的入侵危害 13
一、對本土龜類的影響 13
二、對人類健康的影響 16
第五節 紅耳龜的入侵管理 17
一、制定相關法律 18
二、規範養殖和市場 18
三、科學管理放生活動 18
四、加強宣傳和教育 19
結語 19
參考文獻 20
第二章 外來物種紅耳龜對半咸水環境的生態適應 23
第一節 研究區域的自然概況 23
一、研究區域的位置與氣候 23
二、植物資源 23
三、動物資源 24
第二節 半咸水環境中紅耳龜的活動家域 24
一、半咸水環境中紅耳龜的家域和核域 25
二、紅耳龜在半咸水環境中的家域分析 26
第三節 半咸水環境中紅耳龜對微生境的利用 26
一、微生境 27
二、半咸水環境中紅耳龜微生境分析 29
第四節 紅耳龜在半咸水環境中的食性 29
一、紅耳龜取食的動物種類 30
二、紅耳龜取食的植物種類 31
三、紅耳龜年齡、性別與取食的關繫 31
四、半咸水環境中紅耳龜食性分析 32
第五節 紅耳龜在半咸水環境中的繁殖 33
一、半咸水環境中紅耳龜對巢址的選擇 33
二、半咸水環境中紅耳龜的築巢行為 34
三、半咸水環境中紅耳龜的窩卵數及孵化 35
四、半咸水環境中孵出的紅耳龜稚龜 36
五、半咸水環境中紅耳龜繁殖狀況分析 36
結語 37
參考文獻 38
第三章 紅耳龜對鹽度的耐受性及消化生理調節 42
第一節 紅耳龜對環境鹽度的耐受性 42
一、環境鹽度的設置範圍 42
二、紅耳龜的存活情況 43
三、紅耳龜的臨床特征及病理剖檢 43
第二節 半咸水環境中對紅耳龜的消化生理調節 43
一、半咸水環境中紅耳龜消化酶活力 43
二、半咸水環境中紅耳龜肝髒組織結構變化 45
三、半咸水環境中紅耳龜腸道組織結構變化 45
四、半咸水環境中紅耳龜消化生理分析 45
結語 46
參考文獻 46
第四章 紅耳龜適應半咸水環境的滲透壓調節 48
第一節 半咸水環境中紅耳龜滲透壓的調節 48
一、半咸水環境中紅耳龜血漿滲透壓 49
二、半咸水環境中紅耳龜血漿離子濃度 50
三、半咸水環境中紅耳龜尿液離子濃度 51
四、半咸水環境中紅耳龜血清醛固酮含量 52
五、半咸水環境中紅耳龜Na+-K+-ATP酶活力 52
六、半咸水環境中紅耳龜血液和尿液中含氮代謝物含量 53
七、半咸水環境中紅耳龜對滲透壓的調節分析 55
第二節 半咸水環境中遊離氨基酸對滲透壓的調節 56
一、半咸水環境中紅耳龜肌肉遊離天鼕酰胺含量 57
二、半咸水環境中紅耳龜肌肉遊離組氨酸含量 57
三、半咸水環境中紅耳龜肌肉遊離丙氨酸含量 57
四、半咸水環境中紅耳龜肌肉遊離谷氨酸和谷氨酰胺含量 58
五、半咸水環境中紅耳龜肌肉總遊離氨基酸含量 58
六、半咸水環境中遊離氨基酸對滲透壓的調節作用分析 61
第三節 半咸水環境中紅耳龜肝髒轉錄組學分析 62
一、紅耳龜序列數據質量分析 62
二、紅耳龜基因功能注釋 64
三、根據轉錄組數據分析紅耳龜適應半咸水環境的滲透壓調節機制 72
結語 74
參考文獻 75
第五章 紅耳龜適應半咸水環境的糖脂代謝調節 79
第一節 半咸水環境中紅耳龜對營養物質的利用 79
一、半咸水環境中紅耳龜血糖和肝糖原的含量 79
二、半咸水環境中紅耳龜血清和肝髒可溶性蛋白的含量 80
三、半咸水環境中紅耳龜血清脂質成分的含量 82
四、半咸水環境中紅耳龜對營養物質利用的分析 83
第二節 紅耳龜AMPK亞基分布及在半咸水環境中的表達 83
一、AMPK在紅耳龜各組織中的表達分布 84
二、半咸水環境中紅耳龜AMPK的表達及活力 86
三、半咸水環境中紅耳龜AMPK變化分析 86
第三節 半咸水環境中紅耳龜脂肪代謝相關通路的調控 87
一、半咸水環境中紅耳龜脂肪代謝轉錄因子的表達 87
二、半咸水環境中紅耳龜脂肪合成代謝相關基因的表達 89
三、半咸水環境中紅耳龜脂肪分解代謝相關基因的表達 90
四、半咸水環境中紅耳龜脂肪代謝相關酶的活力 92
五、半咸水環境中紅耳龜脂肪代謝通路分析 93
第四節 半咸水環境中紅耳龜糖代謝相關通路的調控 94
一、半咸水環境中紅耳龜糖代謝相關酶活力及GLUT4含量 95
二、半咸水環境中紅耳龜糖代謝主要調控基因的表達 96
三、半咸水環境中紅耳龜糖代謝通路分析 97
結語 98
參考文獻 99
第六章 紅耳龜適應半咸水環境的抗氧化防御調節 104
第一節 半咸水環境中紅耳龜的抗氧化酶繫統 104
一、超氧化物歧化酶mRNA表達及酶活力 105
二、過氧化氫酶mRNA表達及酶活力 106
三、谷胱甘肽過氧化物酶mRNA表達及酶活力 107
四、谷胱甘肽轉硫酶的mRNA表達 109
五、半咸水環境中紅耳龜抗氧化酶繫統分析 110
第二節 半咸水環境中紅耳龜抗氧化繫統調控通路 111
一、半咸水環境中紅耳龜Nrf2/Keap1信號通路的活化 111
二、半咸水環境中紅耳龜TOR及S6K1信號的激活 112
三、半咸水環境中紅耳龜抗氧化繫統調控通路分析 114
第三節 半咸水環境中紅耳龜氧化應激效應物的變化 115
一、半咸水環境中紅耳龜丙二醛的含量 115
二、半咸水環境中紅耳龜丙二醛變化分析 115
結語 116
參考文獻 117
第七章 紅耳龜適應半咸水環境的免疫調節 121
第一節 半咸水環境中紅耳龜免疫細胞因子調節 121
一、血清中主要免疫細胞因子的含量 122
二、紅耳龜肝髒和心髒主要免疫細胞因子mRNA表達 125
三、半咸水環境中紅耳龜免疫細胞因子分析 128
第二節 半咸水環境中紅耳龜NF-κB通路的調控 129
一、半咸水環境中紅耳龜NF-κB的表達 129
二、半咸水環境中紅耳龜IκB的表達 130
三、紅耳龜適應半咸水環境的NF-κB通路分析 132
結語 133
參考文獻 133
第八章 紅耳龜適應半咸水環境的JAK-STAT通路應答 138
第一節 半咸水環境中紅耳龜JAK-STAT的表達 138
一、半咸水環境中紅耳龜JAK家族反應 138
二、半咸水環境中紅耳龜STAT3應答 140
三、半咸水環境中紅耳龜JAK-STAT通路分析 140
第二節 半咸水環境中紅耳龜JAK-STAT通路的負調控 142
一、細胞因子信號轉導抑制蛋白（SOCS）的表達 142
二、活化STAT蛋白抑制因子（PIAS）的表達 143
三、半咸水環境中紅耳龜JAK-STAT通路的負調控因子分析 145
第三節 半咸水環境中JAK-STAT通路對其靶基因的調控 146
一、半咸水環境中紅耳龜Mcl-1的表達 146
二、半咸水環境中紅耳龜Bcl-xL的表達 147
三、半咸水環境中紅耳龜JAK-STAT通路靶基因分析 147
結語 148
參考文獻 149
第九章 紅耳龜適應半咸水環境的p53信號通路調控 153
第一節 紅耳龜p53基因序列分析 153
一、紅耳龜p53基因序列及其編碼的氨基酸序列 154
二、紅耳龜p53基因與其他物種的進化關繫 154
第二節 半咸水環境中紅耳龜p53基因的表達分布 157
一、紅耳龜p53基因在各組織中的分布 157
二、半咸水環境中p53基因的表達變化 158
三、半咸水環境中紅耳龜p53基因表達分析 159
第三節 半咸水環境中p53對細胞周期的調控 159
一、半咸水環境中紅耳龜CDK的表達 160
二、半咸水環境中紅耳龜細胞周期蛋白的表達 161
三、半咸水環境中紅耳龜p21的表達 162
四、半咸水環境中紅耳龜細胞周期調控分析 163
第四節 半咸水環境中p53對紅耳龜細胞凋亡的調控 164
一、半咸水環境中紅耳龜Bcl-2家族調控 164
二、半咸水環境中紅耳龜caspase 3的表達 166
三、半咸水環境中紅耳龜細胞凋亡發生情況 166
四、半咸水環境中紅耳龜細胞凋亡的分析 167
結語 168
參考文獻 168
第十章 紅耳龜適應半咸水環境的腸道菌群調節 173
第一節 半咸水環境中紅耳龜腸道菌群多樣性分析 174
一、OTU分析 174
二、稀釋曲線分析 174
三、Alpha多樣性指數 174
第二節 半咸水環境中紅耳龜腸道菌群物種組成 175
一、基於門分類水平的物種注釋 175
二、基於屬分類水平的物種注釋 176
三、紅耳龜腸道菌群的特有OTU 177
四、紅耳龜腸道菌群的物種差異分析 178
第三節 半咸水環境中紅耳龜腸道菌群繫統發育及功能預測 180
一、繫統發生進化樹 180
二、紅耳龜腸道菌群16S功能預測 181
三、半咸水環境中紅耳龜腸道菌群功能分析 184
結語 185
參考文獻 185

《外來物種紅耳龜入侵半咸水的生理生態機制》從生理生態學角度繫統闡述了紅耳龜在半咸水環境中的野外生態適應性、滲透壓調節、糖脂代謝調節、應激通路調節、腸道菌群調節等適應對策及相關機制，為紅耳龜的生態危害評估及防控提供了理論依據和實踐指導，為外來入侵物種適應機制的深入研究奠定了基礎，為生態環境保護和生物多樣性保護提供了技術支撐。