●  卷上
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●飲食勞倦門
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●飲食所傷論
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●勞倦所傷論
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●脾胃虛損論
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●中滿腹脹門
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●中滿腹脹論
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●諸腹脹大皆屬於熱論
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●心腹痞門
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●胃脕痛門
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●部分目錄

  《蘭室秘藏》中涉及臨床各科，以內科疾病所占篇幅很大。對飲食勞倦、中滿腹脹、心腹痞、胃脕痛、酒客病、消渴、頭痛、嘔吐、衄血吐血、腰痛、大便結燥、小便淋閉、陰痿陰汗、瀉痢、自汗等15種內科疾病，分別各立一門；對於難於歸類者，列入雜病門；還有痔漏門、瘡瘍門、婦人門、小兒門和眼耳鼻門、口齒咽喉門等共22門，是很好實用的一部臨床著作。