●第1章 整體繫統醫藥學發展進程 1
1.1 新醫藥學與轉化醫學（2010年12月發表） 2
1.2 中醫藥發展亟需第二次思想解放（2015年1月發表） 10
1.3 整體繫統醫藥學（2015年1月發表） 16
1.4 我們的中國夢—新醫藥學（2015年10月發表） 26
1.5 精準醫學與中醫藥現代化研究（2017年1月發表） 38
1.6 從臨床出發，以信號通路為靶標的復方新藥研發策略、途徑與實踐（2018年6月發表） 50
第2章 中藥藥物繫統—整體繫統生物學—臨床繫統生物學 76
2.1 中藥復方有效部分研究方法及理論初探（1997年6月發表） 77
2.2 中藥復方的化學研究體繫（1998年7月發表） 80
2.3 中藥復方物質基礎和藥效相關性研究（1998年7月發表） 84
2.4 化學物質組學與中藥方劑研究（2005年11月發表） 89
2.5 整合化學物質組學的整體繫統生物學：中藥復方配伍和作用機理研究的整體方法論（2006年12月發表） 99
2.6 中醫藥繫統生物學發展及展望（2009年6月發表） 106
2.7 中醫藥臨床繫統生物學研究體繫和實踐（2012年12月發表） 114
第3章 中藥指紋圖譜—現代中藥質量標準體繫—復方藥物研發體繫 125
3.1 多維多息特征譜及其應用（2000年5月發表） 126
3.2 中藥指紋圖譜及其建立原則（2001年3月發表） 128
3.3 中藥指紋圖譜的分類和發展（2001年10月發表） 131
3.4 建立我國現代中藥質量標準體繫的研究（2002年6月發表） 138
3.5 中藥指紋圖譜與全面質量管理（2002年5月發表） 146
3.6 中藥指紋圖譜獲取方法驗證及實際應用（2003年4月發表） 150
3.7 中藥二維信息指紋圖譜模式識別（2008年4月發表） 156
3.8 中藥指紋圖譜理論和實際應用（2006年6月發表） 159
3.9 中藥工程集成化創新與自主創新（2008年6月發表） 162
3.10 中藥復方新藥創制及技術支撐體繫（2008年4月發表） 167
3.11 復方藥物研發創新體繫展望（2008年12月發表） 174
第4章 中藥化學物質組的分離策略和高效分離方法 184
4.1 中藥化學物質組及其分離策略 184
4.2 整體化學物質組和有效化學物質組的獲取方法 196
4.3 中藥有效成分的分離方法 218
第5章 中藥與天然產物的化學生物學 266
5.1 化學生物學的概念與沿革 266
5.2 天然藥物的化學生物學研究 285
5.3 繫統生物學與化學生物學在中藥方劑現代機制研究中的應用 297
第6章 組分新藥丹參心脈膠囊藥學和相關藥效機制的研究 333
6.1 概述 333
6.2 丹參心脈膠囊組方中單味藥材的物質基礎研究 335
6.3 丹參心脈膠囊制備工藝研究 363
6.4 丹參心脈膠囊單味藥及其復方質量控制研究 373
6.5 丹參心脈膠囊藥效研究及初步安全性評價 380
6.6 丹參心脈膠囊初步作用機制研究 386
第7章 尿毒清顆粒治療慢性腎功能衰竭的繫統生物學研究 398
7.1 尿毒清顆粒化學物質組學研究 401
7.2 尿毒清顆粒治療慢性腎功能衰竭動物模型有效性的繫統生物學研究 454
7.3 尿毒清整體繫統生物學研究 533
7.4 基於肝微粒體酶的尿毒清顆粒治療慢性腎功能衰竭安全性研究 541
7.5 小結與展望 577
第8章 糖腎方治療糖尿病腎病的繫統生物學研究及新藥研發 586
8.1 概述 587
8.2 糖腎方治療糖尿病腎病的隨機雙盲安慰劑對照臨床研究 589
8.3 糖尿病腎病橫斷面的臨床繫統生物學研究 601
8.4 糖腎方治療糖尿病腎病的臨床繫統生物學研究 612
8.5 糖腎方化學物質組學分層次整體研究 624
8.6 糖腎方干預動物模型的整體繫統生物學研究 633
8.7 基於網絡藥理學的糖腎方干預糖尿病腎病作用靶點和信號通路預測 645
8.8 由關鍵作用的通路溯源“有效化學成分群” 656
8.9 網絡藥理學所得結果的生物學驗證 658
8.10 基於細胞模型的候選復方新藥優化和驗證 660
8.11 由臨床繫統生物學聚焦而得整合生物標志物體繫和應用 663
8.12 傳統新藥研發過程 678
8.13 小結與展望 678
第9章 神經管畸形的繫統醫藥學研究 681
9.1 神經管畸形的研究背景 681
9.2 定量代謝組學應用於神經管畸形機理研究 685
9.3 定量代謝組學應用於神經管畸形營養干預研究 693
9.4 發病機理研究和營養干預結果聯合分析 701
9.5 營養素干預“預測-驗證”模型的建立 702
9.6 小結與展望 705
第10章 中西藥復方的研發策略與探索研究 709
10.1 復方藥物的發展現狀 710
10.2 中西藥復方藥物羅非考昔復方的研發 713
10.3 西藥復方藥物的研發 728
10.4 小結與展望 761
第11章 基於微流控芯片的創新藥物篩選平臺 764
11.1 微流控芯片藥物篩選繫統發展的背景和意義 765
11.2 微流控芯片藥物篩選的國際近期新研究進展 769
11.3 微流控芯片藥物篩選繫統的研究與探索 779
11.4 基於器官芯片（組織芯片）的微流控藥物肝毒性篩選研究平臺 887
11.5 微流控芯片藥物篩選研究發展的展望與建議 918

《整體繫統醫藥學探索》是作者及其帶領的科研團隊在中醫藥繫統生物學領域多年來探索、創新性研究工作的總結。作者在整合、融合東西方醫藥的研究過程中，形成並提出了中醫藥發展亟需第二次思想解放——創建整體繫統醫藥學（新醫藥學）的理念、研究內容、研究體繫和實踐等，從而產生了整體繫統醫藥學中“從臨床出發，以信號通路為靶標，‘繫統（藥物繫統）-繫統（生命整體繫統）’模式的復方藥物研發體繫”的創新理念體繫。《整體繫統醫藥學探索》繫統、全面地介紹了作者從事中醫藥現代化研究25年來的思辨，理論及方法體繫的提出、發展、完善和研究的全部過程，並輔以作者科研團隊的研究實例，圖文並茂加以說明。