●《生物數學叢書》序
前言
數學符號
第0章 引言
0.1 分子生物學
0.2 數學,統計和計算機科學
第1章 分子生物學一些知識
1.1 DNA和蛋白
1.1.1 雙螺旋結構
1.2 中心定理
1.3 遺傳密碼
1.4 轉化RNA和蛋白序列
1.5 基因不簡單
1.5.1 開始與停止
1.5.2 基因表達的控制
1.5.3 割裂基因
1.5.4 跳躍基因
1.6 生物化學
問題
第2章 圖譜
2.1 引言
2.2 圖
2.3 區間圖
2.4 片段大小的度量
問題
第3章 多重圖譜
3.1 雙消化問題
3.1.1 雙消化問題的多重解
3.2 多重解分類
3.2.1 反射性
3.2.2 重疊等價
3.2.3 重疊尺寸等價
3.2.4 更多的圖論知識
3.2.5 從一條路到另一條路
3.2.6 圖譜及邊界塊圖
3.2.7 圖譜的盒變換
3.2.8 一個例子
問題
第4章 求解DDP的算法
4.1 算法和復雜性
4.2 DDP是NP接近的
4.3 解DDP的方法
4.3.1 整數規劃
4.3.2 劃分問題
4.3.3 TSP
4.4 模擬退火法:TSP和DDP
4.4.1 模擬退火法
4.4.2 TSP
4.4.3 DDP
4.4.4 環狀圖譜
4.5 用真實數據作圖
4.5.1 使數據符合圖
4.5.2 圖譜算法
問題
第5章 克隆與克隆文庫
5.1 有限的隨機克隆數
5.2 接近消化的文庫
5.3 部分消化的文庫
5.3.1 可克隆基的組分
5.3.2 采樣、方法1
5.3.3 設計部分消化文庫
5.3.4 Poisson近似
5.3.5 獲得所有片段
5.3.6 優選表達度
5.4 每個微生物中的基因組
……
第6章 物理基因組圖譜:海洋、島嶼和錨
第7章 序列裝配
第8章 數據庫和快速序列裝配
第9章 動態規劃、兩個序列比對
第10章 多重序列比對
第11章 序列比對用到的概率和統計
第12章 有關序列模式的概率與統計
第13章 RNA二級結構
第14章 樹和序列
第15章 來源與展望
參考文獻
附錄 問題解答和提示
索引
《計算生物學導論:圖譜、序列和基因組》是Introduction to Computational Biology的中文譯著,《計算生物學導論:圖譜、序列和基因組》的意圖是針對有數學技能的人介紹令人著迷的生物數據和問題,並建立更實際的生物數學的基礎。《計算生物學導論:圖譜、序列和基因組》共分15章,其中第1章介紹分子生物學的基本常識,第2-4章介紹圖譜和多重圖譜,第5、6章研究克隆和克隆圖譜,第7章討論DNA序列相關的話題,第8-11章是共同模式下序列比較問題,第12章涉及序列中模式計數的統計問題,第13章敘述RNA二級結構的數學化論述,第14章給出有關序列的進化歷史,書末第15章給出某些關鍵文獻的原始出處。《計算生物學導論:圖譜、序列和基因組》結構完整,內容更新、更全面,《計算生物學導論:圖譜、序列和基因組》適合高等院校數學和生物專業的高年級大學生、研究生和教師閱讀參考,也適合科研單位的等