●第一章總論
第一節新制度出臺的背景
第二節新制度的主要內容與特點
第二章單位預算管理
第一節預算概述
第二節預算編制與執行
第三節決算
第三章資產的管理與核算
第一節資產概述
第二節貨幣資金
第三節應收及預付款項
第四節存貨
第五節固定資產
第六節無形資產
第七節在建工程
第八節待攤支出
第四章負債的管理與核算
第一節負債概述
第二節借入款
第三節待結算醫療款和應繳款項
第四節預收醫療款
第五節應付職工薪酬
第六節應付社會保障費和應交稅費
第七節應付賬款和其他應付款
第五章收入的管理與核算
第一節收入概述
第二節醫療收入
第三節財政補助收入
第四節上級補助收入
第五節其他收入
第六章支出的管理與核算
第一節支出概述
第二節醫療衛生支出
第三節財政基建設備補助支出
第四節其他支出
第七章淨資產的管理與核算
第一節淨資產概述
第二節收支結餘
第三節固定基金
第四節事業基金
第五節專用基金
第六節財政補助結轉（餘）和其他限定用途結轉（餘）
第八章財務報告與財務分析
第一節財務報告概述
第二節資產負債表
第三節收入支出總表
第四節業務收支明細表
第五節財政補助收支明細表
第六節淨資產變動表
第七節財務分析
第九章財務清算與財務監督
第一節財務清算
第二節財務監督
第十章新舊會計制度的銜接
第一節新舊會計制度銜接程序
第二節新舊會計制度科目銜接
附錄
中共中央、國務院關於深化醫藥衛生體制改革的意見
國務院關於印發醫藥衛生體制改革近期重點實施方案（2009—2011年）的通知
國務院關於印發“十二五”期間深化醫藥衛生體制改革規劃暨實施方案的通知
財政部、國家發展和改革委員會、人力資源和社會保障部、民政部、衛生部關於完善政府衛生投入政策的意見
衛生部、財政部、國家人口和計劃生育委員會關於促進基本公共衛生服務逐步均等化的意見
國務院辦公廳關於建立健全基層醫療衛生機構補償機制的意見
衛生部、國家發展和改革委員會、工業和信息化部、監察部、財政部、人力資源和社會保部、商務部、國家食品藥品
監督管理局、國家中醫藥管理局關於印發《關於建立國家基本藥物制度的實施意見》的通知
衛生部、國家發展和改革委員會、工業和信息化部、監察部、財政部、人力資源和社會保障部、商務部、國家食品藥品
監督管理局、國家中醫藥管理局關於印發《國家基本藥物目錄管理辦法（暫行）》的通知
國務院辦公廳轉發國家發展和改革委員會、財政部、衛生部關於清理化解基層醫療衛生機構債務意見的通知
財政部、衛生部關於印發《基本公共衛生服務項目補助資金管理辦法》的通知
衛生部、國家發展和改革委員會、財政部、人力資源和社會保障部、農業部關於印發《鄉鎮衛生院管理辦法（試行）》的通知
人力資源和社會保障部、財政部、衛生部關於印發公共衛生與基層醫療衛生事業單位實施績效工資的指導意見的通知
衛生部辦公廳關於印發《社區衛生服務機構績效考核辦法（試行）》的通知
國務院辦公廳轉發財政部關於深化收支兩條線改革進一步加強財政管理意見的通知
中華人民共和國會計法
事業單位財務規則
會計基礎工作規範
會計檔案管理辦法
財政部關於印發基層醫療衛生機構新舊會計制度有關銜接問題的處理規定的通知
後記