《日本朱子學派之哲學》（1905年）與《日本陽明學派之哲學》（1900年）、《日本古學派之哲學》（1902年）被稱為井上“儒學三部曲”，是近代日本儒學史的奠基性著作。本書是“儒學三部曲”中最晚完成的一部，但處理的卻是江戶思想史中最為主流的部分，即以日本朱子學為核心的正統儒學。本書梳理了朱子學在日本的發展脈絡，將其分為籐原惺窩及惺窩繫統、惺窩繫統以外的朱子學派、南學及暗齋學派、寬政以後的朱子學派、水戶學派，並就其中有代表性的思想家的事跡、著書、學說、學風、主要門人等進行了考察。井上特別強調了朱子學在普及儒家倫理方面的教育功能，以此指出其在現代社會仍然具有不可忽視的實際能量。同時，日本的朱子學與中國的朱子學有何種關鍵差異？日本的朱子學盛極而衰的歷史與它所遺留的課題應該如何在日本思想史中加以定位？本書在這些關鍵點上均提供了重要啟示，有助於我們把握中國儒學的獨特貢獻，弘揚中國文化的精神。
