前 言

第1章  緒論

  1.1  蛋白質組學的產生

    1.1.1  蛋白質組學的產生

    1.1.2  蛋白質組學與傳統蛋白質化學

  1.2  蛋白質組學的發展

    1.2.1  蛋白質組學的發展特色

    1.2.2  蛋白質組學的研究內容

    1.2.3  蛋白質組學發展新趨勢

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  思考題

  參考文獻

第2章  蛋白質組學研究技術

  2.1  表達蛋白質組學

    2.1.1  蛋白質提取技術

    2.1.2  蛋白質分離技術

    2.1.3  蛋白質鋻定技術

  2.2，功能蛋白質組學

    2.2.1  酵母雙雜交

    2.2.2  蛋白質芯片技術

  2.3  結構蛋白質組學

    2.3.1  X射線晶體衍射圖譜法

    2.3.2  核磁共振

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  思考題

  參考文獻

第3章  蛋白質雙向電泳技術

  3.1  蛋白質樣品制備的基本方法

    3.1.1  樣品的破碎與裂解

    3.1.2  蛋白質的沉澱

    3.1.3  蛋白質組分的純化

    3.1.4  裂解液的組成成分及其作用

    3.1.5  蛋白質的定量

  3.2  蛋白質分步提取及亞細胞蛋白質提取

    3.2.1  蛋白質一步提取法

    3.2.2  蛋白質分步順序提取法

    3.2.3  亞細胞蛋白質提取

  3.3  一維等電聚焦電泳

    3.3.1  蛋白質是兩性電解質

    3.3.2  pH梯度的形成

    3.3.3  等電聚焦電泳

    3.3.4  等電聚焦技術類型及其特點

    3.3.5  固相pH梯度技術

  3.4  二維SDS-聚丙烯酰氨凝膠電泳

    3.4.1  二維SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳的原理

    3.4.2  雙向凝膠電泳技術的局限性及改進方法

  3.5  凝膠的染色、圖形獲取與分析

    3.5.1  凝膠的染色

    3.5.2  2-DE數字化圖像的處理

    3.5.3  蛋白質膠上酶解

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  思考題

  參考文獻

第4章  生物質譜鋻定蛋白質技術

  4.1  概述

    4.1.1  生物質譜儀的基本組成

    4.1.2  生物質譜儀的關鍵性能指標

  4.2  基質輔助激光解吸電離質譜

    4.2.1  離子化源

    4.2.2  TOF質量檢測器

  4.3  電噴霧離子化質譜

    4.3.1  ESI工作原理

    4.3.2  質譜與其他技術的串聯使用

  4.4  肽質量指紋圖譜鋻定蛋白質技術

    4.4.1  肽質量指紋圖譜鋻定蛋白質

    4.4.2  肽質量指紋圖譜的優點及其局限性

    4.4.3  PMF檢索工具

    4.4.4  PSD肽片段的部分測序技術

  4.5  串聯質譜數據鋻定蛋白質技術

    4.5.1  串聯質譜測定多肽序列原理

    4.5.2  串聯質譜的優點及局限性

    4.5.3  肽序列標簽鋻定技術

    4.5.4  18O標記從頭測序技術

    4.5.5  其他蛋白質鋻定技術

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  思考題

  參考文獻

第5章  蛋白質翻譯後修飾

  5.1  磷酸化蛋白質的鋻定

    5.1.1  概述

    5.1.2  磷酸化蛋白質的檢測方法

    5.1.3  磷酸化蛋白質或多肽的分離與富集

    5.1.4  磷酸化蛋白質的質譜檢測與分析

  5.2  糖基化蛋白質的鋻定

    5.2.1  概述

    5.2.2  糖基化蛋白質的種類

    5.2.3  糖基化蛋白質的分離與富集技術

    5.2.4  糖基化蛋白質的解析

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  思考題

  參考文獻

第6章  蛋白質組學的定量研究技術

  6.1  熒光定量蛋白質分析技術

    6.1.1  熒光染料染色技術

    6.1.2  2D-DIGE蛋白質組技術

  6.2  基於質譜的蛋白質組定量分析技術

    6.2.1  代謝標記

    6.2.2  提取後標記

    6.2.3  非同位素標記定量分析

    6.2.4  用AQuA肽定量

  6.3  蛋白質芯片技術

    6.3.1  蛋白質芯片的分類

    6.3.2  蛋白質芯片的應用

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  思考題

  參考文獻

第7章  蛋白質結構分析技術

  7.1  蛋白質的結構

    7.1.1  蛋白質結構的組織層次

    7.1.2  蛋白質結構的實驗測定及結構基因組學

    7.1.3  蛋白質結構的分類

    7.1.4  蛋白質結構與功能的關繫

  7.2  蛋白質結構比對

    7.2.1  蛋白質結構比對的原理

    7.2.2  常用的蛋白質結構比對方法

  7.3  蛋白質二級結構預測

    7.3.1  常用的二級結構預測方法

    7.3.2  不同二級結構預測方法的評價

    7.3.3  二級結構預測的展望

  7.4  蛋白質三級結構預測

    7.4.1  同源模擬

    7.4.2  折疊識別

    7.4.3  從頭計算法

  本章小結

  思考題

  參考文獻

第8章  互作蛋白質組研究技術

  8.1  蛋白質-蛋白質相互作用的離體研究技術

    8.1.1  蛋白質親和層析

    8.1.2  表面等離子共振技術

  8.2  酵母雙雜交技術

    8.2.1  酵母雙雜交技術的原理

    8.2.2  酵母雙雜交技術的試驗流程

    8.2.3  酵母雙雜交技術的優缺點

    8.2.4  雙雜交技術的新進展

  8.3  免疫共沉澱技術

    8.3.1  免疫共沉澱法的原理

    8.3.2  免疫共沉澱法的實驗流程

    8.3.3  免疫共沉澱技術的應用

  8.4  藍色非變性膠技術

    8.4.1  BN—PAGE技術的原理

    8.4.2  BN—PAGE技術的實驗流程

    8.4.3  BN—PAGE的應用

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  思考題

  參考文獻

第9章  蛋白質組信息學

  9.1  蛋白質組信息學簡介

    9.1.1  蛋白質組信息學的產生與發展

    9.1.2  蛋白質組信息學的研究內容

  9.2  蛋白質組信息學資源

    9.2.1  蛋白質序列數據庫

    9.2.2  蛋白質模式模體數據庫PROSITE

    9.2.3  蛋白質結構數據庫

    9.2.4  蛋白質結構分類數據庫

    9.2.5  蛋白質互作網絡數據庫

    9.2.6  蛋白質功能信息學數據庫

  9.3  蛋白質組信息學技術的應用

    9.3.1  序列比對

    9.3.2  結構預測

    9.3.3  藥物篩選及設計

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  思考題

  參考文獻