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  • 繫統生物學的理論、方法和應用
    該商品所屬分類:研究生 -> 公共課
    【市場價】
    617-896
    【優惠價】
    386-560
    【作者】 (德)柯利普 等著,賀福初,楊芃原,朱雲平 主譯 
    【所屬類別】 圖書  教材  研究生/本科/專科教材  公共課 
    【出版社】復旦大學出版社 
    【ISBN】9787309057874
    【折扣說明】一次購物滿999元台幣免運費+贈品
    一次購物滿2000元台幣95折+免運費+贈品
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    內容介紹



    開本:16開
    紙張:膠版紙
    包裝:精裝

    是否套裝:否
    國際標準書號ISBN:9787309057874
    作者:(德)柯利普等著,賀福初,楊芃原,朱雲平主譯

    出版社:復旦大學出版社
    出版時間:2008年01月 

        
        
    "
    內容簡介
    繫統生物學是一門典型的交叉學科,需要生命科學、信息科學、數學和計算機科學等多學科的交叉研究;而目前國內還沒有一本書能涵蓋所有這些學科的內容。本書提供了進入繫統生物學領域所必需的基礎知識和學科概貌,內容體繫連貫完整、深入淺出,非常適合作為課程教材和研究參考書。
    全書分為3個部分。第1部分介紹繫統生物學的主要基礎:細胞生物學、數學和實驗技術。第2部分介紹當前的計算建模和數據挖掘策略,包括代謝、信號轉導、細胞周期、基因表達等各種細胞進程及其相互作用的各種細節;介紹了建模中的一些概念,並討論了如何用不同的模型來解決一些常見的問題,如怎樣解讀數據、在特定條件下該應用哪種模型。第3部分對目前互聯網上可獲得的幫助和資源進行了概述性介紹,同時介紹了作者自己常用的一些建模工具;並對信息交換*必要的、從而也是構成繫統生物學不可或缺的支柱數據庫進行了概述。
    作者簡介
    賀福初,中國科學院院士,第三世界科學院院士。1962年出生於湖南安鄉,1982年畢業於復旦大學後考入軍事醫學科學院攻讀碩士學位並入伍,相繼獲生物化學碩士、細胞生物學博士學位。現任事醫學科學院副院長、研究員、博士生導師,兼任復旦大學生物醫學研究院院長、教授。
    目錄
    第1部分 概論
    第1章 基本原理
    1.1 繫統生物學是生物學
    1.2 繫統生物學是建模
    1.3 繫統生物學是數據整合
    1.4 繫統生物學是一門有生機的科學
    第2章 生物學概要
    引言
    2.1 生命的起源
    2.2 細胞的分子生物學
    2.3 結構細胞生物學
    2.4 基因的表達
    2.5 細胞周期
    第3章 數學概要第1部分 概論
    第1章 基本原理
    1.1 繫統生物學是生物學
    1.2 繫統生物學是建模
    1.3 繫統生物學是數據整合
    1.4 繫統生物學是一門有生機的科學
    第2章 生物學概要
    引言
    2.1 生命的起源
    2.2 細胞的分子生物學
    2.3 結構細胞生物學
    2.4 基因的表達
    2.5 細胞周期
    第3章 數學概要
    引言
    3.1 線性代數
    3.2 常微分方程
    3.3 差分方程
    3.4 統計學
    3.5 圖和網絡理論
    3.6 隨機過程
    第4章 實驗技術概要
    引言
    4.1 基本技術
    4.2 高級技術
    第2部分 繫統生物學的標準模型和方法
    第5章 代謝
    引言
    5.1 酶動力學和熱力學
    5.2 代謝網絡
    5.3 代謝控制分析
    第6章 信號轉導
    引言
    6.1 細胞內和細胞間通訊的結構與功能
    6.2 受體配體相互作用
    6.3 信號通路的結構組成
    6.4 信號轉導:動力學與調節特征
    第7章 選取的生物學過程
    引言
    7.1 生物學振蕩
    7.2 細胞周期
    7.3 衰老
    第8章 基因表達建模
    引言
    8.1 基因表達建模
    8.2 啟動子識別
    8.3 真核基因表達特定過程的建模
    8.4 E.coli 操縱子調控的建模
    第9章 基因表達數據的分析
    引言
    9.1 數據獲取
    9.2 倍數變化分析
    9.3 聚類算法
    9.4 基因表達數據的驗證
    9.5 分類方法
    9.6 反向工程遺傳網絡
    第10章 進化和自組織
    引言
    10.1 準種和超循環
    10.2 進化的其他數學模型
    10.3 用原理預測生物繫統
    第11章 數據整合
    引言
    11.1 數據庫網絡
    11.2 異質數據的信息度量
    11.3 雙邊聚類
    第12章 繫統生物學展望
    12.1 繫統生物學:未來生物學研究和醫學實踐的核心
    12.2 生物學研究在繫統生物學階段的實驗設計
    12.3 繫統生物學時代的出版物
    12.4 繫統生物學和文本挖掘
    12.5 醫學中的繫統生物學
    12.6 藥物研發中的繫統生物學
    12.7 食品生產和生物工程中的繫統生物學
    12.8 生態學中的繫統生物學
    12.9 繫統生物學與納米技術
    12.10 指導新物種的設計
    12.11 計算的局限性
    12.12 潛在的危險
    第3部分 計算機信息檢索和檢驗
    第13章 數據庫和網絡上的工具
    引言
    13.1 Gene Ontology
    13.2 KEGG
    13.3 BRENDA
    13.4 NCBI的數據庫
    13.5 EBI的數據庫
    13.6 SwissˉProt, TrEMBL和UniProt
    13.7 Reactome
    13.8 PDB
    13.9 TRANSFAC 和 EPD
    13.10 Genome Matrix
    第14章 建模工具
    引言
    14.1 建模和可視化
    14.2 模型交換語言,數據格式
    在線試讀
    1.1 繫統生物學是生物學
    生命作為宇宙間復雜的現像之一,已利用繫統化的方法在植物學、動物學、生態學以及單細胞的組成和分子生物學等領域得到了研究。長期以來生物學家對細胞中的各部分是如何運行的進行了透徹的研究:他們研究了各種分子的生物化學性質,蛋白質、DNA和RNA的結構,DNA復制、轉錄和翻譯的法則以及生物膜的結構和功能等等。此外,關於不同類型網絡素間的相互作用的理論概念也得到了發展。這條研究路線的下一步是進一步朝著細胞、器官和機體以及(主要是)細胞進程如細胞通訊、細胞分裂、體內穩態和適應的繫統化研究方向努力。這類研究方法可以被稱為繫統生物學。
    為了更好理解細胞是如何工作的,細胞進程是如何調控的,以及細胞對環境擾動如何反應或甚至是預期那些變化。現在將生物學和自然科學中的不同領域整合起來,正其時也。生物學進程更為繫統化圖景的發展伴隨並基於實驗技術和方法學的革命。盡管仍非常昂貴,新的高通量方法已經使得我們可以在同一時刻並以適當的時間分辨率測量細胞中所有基因的表達水平。熒光標記和尖端的顯微技術允許追蹤單細胞中的個別分子。對細胞組分和細胞進程在時空上的細致研究是進一步闡明細胞調控的重要前提。
    繫統生物學的發展部分地為科學家的興趣所推動,但更多的是由它具有的高應用潛力所推動。生物工程的生產需要高預測能力的工具,以便廉價、可靠地設計具有期望特性的細胞。鋻於對衛生保健存在許多期望,調控網絡模型是必要的,以便認識其在疾病狀況下的改變,並發展出治療該疾病的方法。而且,由於衛生保健朝著個體化和預測醫學方面發展的矚目趨勢(Weston和Hood 2004),使得在藥物研發、藥效驗證、診斷學以及治療監控等領域內對細胞網絡精確公式化和繫統行為預測的需求日益增加。以表皮生長因子受體這個新一代抗癌藥物靶標為例,它屬於一個至少包含4種相關受體的家族。這些受體能夠被30多種的不同分子所啟動。因此,面對這種復雜裝置,有必要繪制其布線圖,以件在響應各種不同刺激和致病中所起的作用。詳細模型一經建立,所有可能擾動的影響均可以相當廉價地用計算機預測。
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