本書的內容安排可以概括為三大塊，前面三個章節介紹了分子生物學的基礎內容。這些章節歸納了遺傳學與分子生物學的歷史、誕生、發展及展望，生物大分子的基本結構和性質及那些決定大分子結構及功能的化學定律，遺傳物質的維持及維護(遺傳物質的復制、損傷修復及遺傳重組)。隨後，安排了分子生物學的重要內容：遺傳信息的傳遞過程(第四章轉錄，第五章翻譯)以及分子生物學的核心內容：基因表達調控(第六章原核基因表達調控．第七章真核基因組及其基因表達調控)。後，是分子生物學的一些其他內容(第八章細胞信號調節，第九章癌分子生物學，第十章分子生物學研究方法，第十—章基因組學)，其中，第十章分子生物學研究方法著重培養學生應用能力。每章後附有小結和思考題，概括本章的主要內容，使讀者能抓住復習的重點。
    全書在保持分子生物學學科的知識體繫和內容框架的基礎上，適當增加了實驗研究示例及分子生物學應用的實例，並將重點放在原理及概念上，討論部分采用了圖解的方法，而主要用方框來介紹背景資料、慎重選用實驗或研究進展，以避免此書變得過於龐雜。
    本書堅持基礎性、通用性和應用性相結合，在重點闡述基本理論、原理和方法的同時，盡可能反映分子生物學知識或技術的應用，同時介紹一些*進展，以突出了大部分院校生物類專業偏向應用的特點，適合用作普通高等學校生物科學、生物技術及生物工程等相關專業的教材和參考書。