了得網研究生_繫統生物學中的網絡分析方法

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繫統生物學中的網絡分析方法
該商品所屬分類：研究生 -> 研究生
【市場價】	198-288元
【優惠價】	124-180元
【作者】	編者鄒權陳啟安曾湘祥劉向榮
【所屬類別】	圖書教材研究生/本科/專科教材理學
【出版社】	西安電子科大
【ISBN】	9787560635385
【折扣說明】	一次購物滿999元台幣免運費+贈品一次購物滿2000元台幣95折+免運費+贈品一次購物滿3000元台幣92折+免運費+贈品一次購物滿4000元台幣88折+免運費+贈品
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內容介紹

開本：16開

紙張：膠版紙

包裝：平裝-膠訂

是否套裝：否

國際標準書號ISBN：9787560635385

作者：編者:鄒權//陳啟安//曾湘祥//劉向榮...

出版社：西安電子科大

出版時間：2015年04月

內容簡介

生物繫統通常是一個復雜網絡，它可以理解成任何與生物繫統有關的網絡，包括蛋白質相互作用網絡、基因調控網絡、代謝網絡、信號傳導網絡、生物進化網絡，以及人工神經網絡、食物鏈網絡等。本書主要關注的是與生物信息學相關的生物網絡和受生物網絡啟發的計算模型。
鄒權、陳啟安、曾湘祥、劉向榮編寫的《繫統生物學中的網絡分析方法》從信息科學的視角來分析生物網絡，可對具有計算背景的生物信息學入門研究人員有所幫助，也有助於具有生物背景的研究人員理解、掌握各種生物網絡軟件。本書可作為本科高年級或研究生相關課程的參考書，也可用於指導相關的數學建模比賽。

章生物信息學和繫統生物學基礎知識
1.1 基本概念
1.2 中心法則
1.3 表觀遺傳學
1.3.1 非編碼RNA
1.3.2 microRNA
1.3.3組蛋白修飾
1.4 繫統生物學
1.4.1 生物繫統與生物網絡
1.4.2 繫統生物學語言SBM
1.5 本章小結
第二章網絡化建模的基本知識
2.1 馬爾科夫模型
2.1.1 簡述章生物信息學和繫統生物學基礎知識
1.1 基本概念
1.2 中心法則
1.3 表觀遺傳學
1.3.1 非編碼RNA
1.3.2 microRNA
1.3.3組蛋白修飾
1.4 繫統生物學
1.4.1 生物繫統與生物網絡
1.4.2 繫統生物學語言SBM
1.5 本章小結
第二章網絡化建模的基本知識
2.1 馬爾科夫模型
2.1.1 簡述
2.1.2 舉例分析
2.2 隱馬爾科夫模型
2.2.1 簡介
2.2.2 HMM的改進
2.2.3 隱馬爾科夫模型算法
2.3 貝葉斯網絡模型
2.3.1 貝葉斯網絡的基本概念
2.3.2 貝葉斯網絡定理
2.3.3 貝葉斯網絡的拓撲結構
2.3.4 簡單的貝葉斯網絡的例子
2.4 Petri網的構建和應用
2.4.1 Petri網簡介
2.4.2 Petri網的數學定義和特點
2.4.3 Petri網的應用
2.4.4 Petri網的行為特征
2.4.5 Pet網的性能分析
2.5 布爾網絡的構建
2.5.1 布爾網絡簡介
2.5.2 布爾網絡的狀態
2.5.3 布爾網絡動態行為研究
2.6 網絡比對的模型和算法
2.7 網絡聚類的模型和算法
2.8 網絡可視化軟件介紹
2.8.1 Pajek簡介
2.8.2 Pajek數據對像
2.8.3 Pajek實例演示
2.8.4 Pajek常用功能介紹
2.9 本章小結
第三章大規模網絡化數據的處理方法
3.1 圖問題概論
3.2 圖問題的研究領域及算法
3.2.1 圖的基本分析
3.2.2 圖的匹配
3.2.3 圖數據中的關鍵字查詢
3.2.4 頻繁模式挖掘
3.2.5 圖的聚類
3.2.6 圖的分類
3.2.7 社交網絡分析
3.3 圖分析的發展——大數據
時代的到來
3.4 單機分析工具
3.4.1 Pajek
3.4.2 UINET
3.4.3 NetworkX
3.4.4 NetMiner 3
3.5 大圖分析——分布式圖
計算模型介紹
3.5.1 MR—BSt
3.5.2 GraphIab
3.5.3 GraphBuilder
3.6 本章小結
第四章蛋白質相互作用網絡的建模與分析
4.1 問題描述
4.2 相關研究
4.2.1 實驗方法
4.2.2 計算生物學方法
4.2.3 蛋白質相互作用的評估
4.2.4 可信度的評估和提高
4.2.5 蛋白質相互作用網絡全局拓撲結構的度量準則
4.2.6 蛋白質相互作用網絡的局部結構特點
4.2.7 具有生物學意義的子網
4.2.8 蛋白質相互作用網絡研究面臨的困難與挑戰
4.2.9 一些蛋白質相互作用的數據庫
4.3 確定蛋白質相互作用網絡的計算方法
4.3.1 基於基因組信息的方法
4.3.2 基於進化信息的方法
4.3.3 基於蛋白質結構的方法
4.3.4 基於氨基酸序列的方法
4.3.5 基於自然語言處理的文獻挖掘方法
4.3.6 基於機器學習方法預測蛋白質相互作用
4.4 蛋白質相互作用數據可靠性評價
4.4.1 相似性評價指標
4.4.2 有效性評價指標
4.5 本章小結
第五章基因調控網絡的建模與分析
5.1 簡介
5.2 基因調控網絡
5.3 布爾網絡模型
5.3.1 普通布爾網絡
5.3.2 概率布爾網絡
5.4 數學建模
5.4.1 線性組合模型
5.4.2 加權矩陣模型
5.4.3 微分方程模型
5.5 貝葉斯網絡模型
5.5.1 靜態貝葉斯網絡模型
5.5.2 動態貝葉斯網絡模型
5.6 基因調控網絡各種構建模型的比較
5.7 本章小結
第六章表觀遺傳網絡的建模與分析
6.1 簡介
6.2 microRNA與疾病的網絡關繫構建
6.2.1 數據獲取與數據庫構建
6.2.2 網絡構建與數據分析
6.3 基於布爾網絡的microRNA挖掘
6.3.1 構建microRNA網絡的理論依據
6.3.2 microRNA靶基因預測數據分析
6.3.3 布爾型microRNA網絡的構建與分析
6.3.4 布爾型phenome-microRN.Aome網絡的構建
6.3.5 基於布爾型網絡的疾病microRNA挖掘算法
6.4 基於權重網絡的microRNA挖掘
6.4.1 權重型microRNA網絡的構建算法
6.4.2 權重型phenome-microRNAome網絡的構建
6.5 組蛋白修飾與選擇性剪切外顯子表達間的調控網絡
6.5.1 簡介
6.5.2 基於貝葉斯網絡的組蛋白調控網絡構建
6.5.3 組蛋白修飾與外顯子表達間調控網絡
6.5.4 生物驗證及分析
6.6 非穩態組蛋白修飾調控網絡構建方法研究
6.6.1 hmDBN模型及結構學習算法
6.6.2 數據測試與分析
6.6.3 結果驗證
6.7 本章小結
第七章進化樹與進化網絡的建模方法
7.1 進化樹
7.1.1 分子數據
7.1.2 DNA進化
7.1.3 進化模型
7.2 常見的進化樹構建算法
7.2.1 距離法
7.2.2 簡約法
7.2.3 似然法
7.2.4 算法比較
7.3 基於鄰接法的分支交換操作
7.3.1 NNI、SPR、TBR和p-ECR搜索能力分析
7.3.2 p—ECRN.J操作
7.4 基於PS的進化樹構建算法
7.5 結合QP和鄰接法的進化樹構建算法
7.5.1 QP算法
7.5.2 鄰接法
7.5.3 QPNJ算法
7.6 基於同倫方法的SEM算法
7.6.1 似然法和SEM算法
7.6.2 基於同倫方法的SEM算法推導
7.6.3 斂性證明
7.7 進化網
7.7.1 有根繫統發生網絡構建方法
7.7.2 有根繫統發生網絡空間上測度的定義
7.8 本章小結
第八章神經網絡啟發的計算模型
8.1 引言
8.2 生物神經網絡
8.2.1 生及其模型
8.2.2 生的功能特性
8.2.3之間的信息傳遞
8.3 人工神經網絡
8.3.1 人工神經網絡的發展
8.3.2 人工神經網絡的應用領域及發展前景
8.3.3 人工神經網絡的基本特性
8.4 人工神經網絡的建模基礎
8.4.1 人模型
8.4.2 人工神經網絡拓撲結構類型
8.4.3 人工神經網絡信息流向類型
8.4.4 神經網絡的學習
8.5 感知器神經網絡
8.5.1 單層感知器
8.5.2 多層感知器
8.5.3 基於B-F算法的多層感知器模型
8.5.4.多層感知器的主要能力
8.6 自組織神經網絡
8.6.1 自組織映射模型
8.6.2 自組織競爭過程
8.6.3 ART網絡
8.6.4 反饋神經網絡
8.7 本章小結
第九章細胞網絡啟發的計算模型
9.1 引言
9.1.1 細胞
9.1.2 細胞自動機
9.1.3 Conway的生命遊戲Game of Life
9.1.4.宇宙就是一個極其復雜的細胞自動機
9.1.5 現代細胞自動機的應用
9.2 膜計算
9.2.1 標準P繫統
9.2.2 細胞型膜繫統
9.2.3 組織型膜繫統
9.3 細菌智能算法
9.3.1 細菌的覓食行為
9.3.2 細菌的趨藥性
9.3.3 細菌群體的適應性決策原理：啟發機器人設計
9.4 原始細胞網絡
9.5 本章小結
第十章生物社會網絡啟發的計算模型
10.1 引言
10.2 對鳥群網絡的研究
10.3 對蟻群的研究
10.3.1 螞蟻的覓食行為
10.3.2 孵化分類啟發
10.3.3 協作運輸啟發
10.3.4 勞動分工啟發
10.4 對魚群的研究
10.5 對蜂群的研究
lO.5.1 蜜蜂繁殖
10.5.2 蜜蜂采蜜
10.6 對青蛙群體的研究
10.7 本章小結

商品詳情

基本信息

商品名稱：繫統生物學中的網絡分析方法
作者：編者:鄒權//陳啟安//曾湘祥//劉向榮	定價：40	開本：16開
出版社：西安電子科大	ISBN號：9787560635385	頁數：280
出版時間：2015-04-01	版次：1	商品類型：圖書
印刷時間：2016-11-01	印次：2

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