本專著通過功能基因組學、比較基因組學、生物信息學和表觀遺傳學等研究方法,針對豬、雞品質、遺傳抗性、生長、繁殖等典型的復雜性狀,定位、分離和克隆影響這些復雜經濟性狀的基因和基因網絡,闡明其形成和調控這些復雜經濟性狀表型的分子遺傳機理。同時,研制了高通量基因型診斷技術平臺,發展優質基因的平衡集成方法,提出了繫統平衡育種理論。包括7個板塊的研究內容:1.生長發育性狀的功能基因組;2.品質性狀形成的分子基礎;3.繁殖性狀形成的遺傳機理;4.抗病和抗逆基因的克隆分析;5.重要復雜性狀比較基因組;6.表觀遺傳和miRNA影響性狀形成的機制;7.重要經濟性狀的分子改良。