南水北調工程是實現我國水資源優化配置、促進經濟社會可持續發展、保障和改善民生的戰略性基礎設施。為保障南水北調中線水源安全，國務院先後於2006年1月批復《丹江口庫區及上遊水污染防治和水土保持規劃》，2012年6月批復《丹江口庫區及上遊水污染防治和水土保持“十二五”規劃》。通過規劃實施，丹江口庫區及上遊的水質得到保障、生態環境和水源涵養能力得到改善，保證南水北調中線按期實現了調水目標，2014年12月12日南水北調中線正式通水運行。
“十三五”期間，南水北調中線水源污染防治和水土保持的成效仍需進一步鞏固，保障中線工程持續供水安全仍面臨壓力。為此，受國務院南水北調工程建設委員會辦公室委托，由環境保護部環境規劃院牽頭會同中國國際工程咨詢公司和長江水利委員會長江流域水土保持監測中心站組成聯合體，承擔了《丹江口庫區及上遊水污染防治和水土保持“十三五”規劃》編制工作。
《丹江口庫區及上遊水污染防治和水土保持“十三五”規劃研究報告》是規劃編制過程中相關研究成果的總結，共分為8章。第1章為總論，主要介紹規劃編制的背景、思路、技術路線和主要內容；第2章為形勢分析，在數據分析的基礎上，介紹了流域水環境、主要污染物排放以及水土保持等狀況，總結了面臨的問題和壓力；第3章為規劃分區體繫，包括劃分、基礎數據核定、優先篩選等內容，為推進精細化管理提供空間基礎；第4章為規劃目標及指標；第5章為規劃任務，從污染防治、生態建設、風險防範、經濟社會發展等方面設計了“十三五”期間的重點工作；第6章介紹了針對水污染防治優先的細化研究成果，每個優先包括問題分析、目標與思路、治理方案等內容；第7章為規劃項目研究，包括項目類型設置、篩選原則、投資匡算、效益估算、實施機制等內容；第8章從組織、資金、科技等角度研究了促進規劃實施的政策機制保障。