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  • 高通量DNA測序和基因組學新型技術
    該商品所屬分類:自然科學 -> 自然科學
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    【作者】 (澳)米切爾森(Mitchelson,KR) 編著 
    【所屬類別】 圖書  自然科學  生物科學  生物化學 
    【出版社】科學出版社 
    【ISBN】9787030203465
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    內容介紹



    開本:16開
    紙張:膠版紙
    包裝:精裝

    是否套裝:否
    國際標準書號ISBN:9787030203465
    作者:(澳)米切爾森(Mitchelson,K.R.)編著

    出版社:科學出版社
    出版時間:2008年01月 

        
        
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    內容簡介
    三十年前,由Sanger和G訂bert分別建立了DNA雙脫氧測序和化學測序技術。現在DNA測序的規模逐漸擴大,從每天能讀幾千個堿基對序列的小規模測序,發展到如
    今每天能夠進行成千上萬個序列的精確測定,成為數的“產業”。世界上幾個大的測序中心建立了大規模的基因組測序平臺,支持幾乎所有大學和大型醫院的DNA測序工作。國際生物信息學中心擁有存儲約一千五百萬堿基對序列信息的能力,我們正處於一個“後基因組”時代。然而DNA測序在生命科學和醫學的許多領域,仍然是一個主要的診斷和研究手段。這種強勁的需求,推動了新的測序技術的發展。這些新技術既不用電泳,也不用Sanger測序方法,而是通過DNA合成的方法進行測序,包括在固相表面上進行的多重平行測序反應,每一個循環的數據通過成像的方法獲得。近有一項由454生命科學和馬普研究所制定的計劃,使用合成法測序技術測定穴居人基因組,該計劃顯示了這些新的DNA測序技術在後基因組學研究中的強大作用。這將成為第二代全人類基因組項目,而且預計將進一步陝速提升我們對人類基因組生物學知識的認識,加深我們對人類遺傳性疾病機制的了解。
    本書彙集了DNA測序技術的一些新的進展,全書的框架由一繫列綜述組成,主要包括Sange,和SBS測序方法的進展(Kumar and Fuller)、毛細管電泳和微型集成繫統三十年前,由Sanger和G訂bert分別建立了DNA雙脫氧測序和化學測序技術。現在DNA測序的規模逐漸擴大,從每天能讀幾千個堿基對序列的小規模測序,發展到如
    今每天能夠進行成千上萬個序列的精確測定,成為數的“產業”。世界上幾個大的測序中心建立了大規模的基因組測序平臺,支持幾乎所有大學和大型醫院的DNA測序工作。國際生物信息學中心擁有存儲約一千五百萬堿基對序列信息的能力,我們正處於一個“後基因組”時代。然而DNA測序在生命科學和醫學的許多領域,仍然是一個主要的診斷和研究手段。這種強勁的需求,推動了新的測序技術的發展。這些新技術既不用電泳,也不用Sanger測序方法,而是通過DNA合成的方法進行測序,包括在固相表面上進行的多重平行測序反應,每一個循環的數據通過成像的方法獲得。近有一項由454生命科學和馬普研究所制定的計劃,使用合成法測序技術測定穴居人基因組,該計劃顯示了這些新的DNA測序技術在後基因組學研究中的強大作用。這將成為第二代全人類基因組項目,而且預計將進一步陝速提升我們對人類基因組生物學知識的認識,加深我們對人類遺傳性疾病機制的了解。
    本書彙集了DNA測序技術的一些新的進展,全書的框架由一繫列綜述組成,主要包括Sange,和SBS測序方法的進展(Kumar and Fuller)、毛細管電泳和微型集成繫統
    (Xiong and Cheng)、MS測序(Ehrich et al.)和應用(Mitchelson et al.)。還包括了一些*的進展,如SBS技術的新進展(Margulies et al.)、核酸染料SBS測序方法(Edwards et al.)、通過循環合成實現單分子測序(Hebert and Brasiavsky)、納米孔測序(Lee and Meller),以及陣列DNA的光標測(Schwartz et al.)。在書的後,討論了基因組拼接(Mc(;rath)中的生物信息學工具、古代和環境DNA樣品(Kowalchuket al.)的測序和SBS序列拼接工具(Keith et al.)等SBs測序的新應用。作者真誠希望此書的出版和發行能夠引起學生和研究人員對測序這個關鍵基因組學技術的興趣,並引發相關的技術革新。
    作者簡介
    Keith Mitchelson是博奧生物有限公司,生物芯片北京國家工程研究中心的研究員,也是清華大學醫學院醫學繫統生物學研究中心的訪問學者。
    目錄
    現有技術
    章 概述:DNA測序技術進展
    1引言
    1.1超高通量測序能力的生物技術意義
    2測序前沿技術
    2.1毛細管電泳和Sanger測序法
    2.2高通量毛細管微陣列測序
    2.3染料和檢測器
    2.4微型芯片電泳
    2.5基於微型毛細管芯片的毛細管電泳測序
    2.6質譜測序
    3固相陣列測序裝置
    3.1超敏感的檢測器和測序儀
    3.2合成測序現有技術
    章 概述:DNA測序技術進展
    1引言
    1.1超高通量測序能力的生物技術意義
    2測序前沿技術
    2.1毛細管電泳和Sanger測序法
    2.2高通量毛細管微陣列測序
    2.3染料和檢測器
    2.4微型芯片電泳
    2.5基於微型毛細管芯片的毛細管電泳測序
    2.6質譜測序
    3固相陣列測序裝置
    3.1超敏感的檢測器和測序儀
    3.2合成測序
    3.3 DNA單分子測序
    3.4雜交重組測序
    4技術展望
    4.1納米孔膜
    4.2DNA合成的直接電學檢測
    5基因組短片段測序應用
    5.1基於重測序的基因分型
    5.1.1polony基因分型
    5.1.2焦磷酸測序的基因分型
    5.1.3多態性比率測序
    5.1.4BEAMing
    5.2古生物基因組
    5.3洞人基因組
    5基因組
    5.5重復DNA序列的SAM測序
    5.6轉錄組和表達RNA序列分析
    5.7MPSS和基因組分析
    5.8光學定位
    6小結
    參考文獻
    第二章芯片毛細管電泳與繫統遺傳分析繫統
    摘要
    1引言
    1.1各種基於芯片的毛細管電泳繫統
    2芯片設計和流體操作
    2.1芯片設計
    2.2流體操作
    3材料和制作
    3.1材料
    3.2制作
    3.2.1玻璃材料的制作步驟
    3.2.2高分子材料的制作步驟
    4檢測
    4.1光學檢測
    4.1.1激光誘導的熒光檢測
    4.1.2吸光度檢測
    4.1.3化學發光檢測
    4.2電化學檢測
    4.2.1 電流檢測
    4.2.2 電導檢測
    4.2.3 電位檢測
    4.3質譜
    5表面修飾
    5.1動態包被
    5.1.1玻璃/石英基片的包被
    5.1.2PMMA基片的包被
    5.1.3PDMS基片的包被
    5.2永久性包被
    5.2.1玻璃/石英基片的永久包被
    5.2.2PMMA基片的永久包被
    5.2.3PDMS基片的永久包被
    6應用
    6.1核酸分析
    6.1.1篩分介質
    6.1.2依大小排列DNA片段
    6.1.3基因分型
    7DNA測序
    ……
    第三章應用MALDI-TOF質譜法比較序列分析——利用知己序列尋找新的序列
    第四章基於核苷酸偶聯染料的DNA測序進展
    合成測序技術平臺
    第五章454生命科學(454Lif Sciences)皮升級測序繫統
    第六章合成法DNA測序的集成繫統
    單分子測序
    第七章單分子熒光顯微鏡及其在基於循環合成的單分子測序中的應用
    第八章基於單個DNA鏈的納米級核苷酸序列快速測序
    第九章全基因組水平的單分子測序繫統
    序列驗證和分析
    第十章測序和誘導突變相結合有利於短讀長獲得全新百萬級的DNA片段序列
    第十一章基因組測序和拼接
    第十二章具有高污染風險的樣品——古DNA和環境DNA核酸序列信息的有效測定
    內容索引


     
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