1993年作者申請到國家*“八五”研究規劃課題“20至40年代的中國經濟思想”後，即組織本學科的博士生、碩士生們分工研究並撰寫初稿。因他們在校的時間不長，又要撰寫學位論文，不可能全身心投入，大多隻能交出一兩篇稿子，隻有博士生丁孝智寫了多篇，《近代中國經濟思想史（下冊）》采用作為初稿的有李大釗、*、張聞天、蔣介石、孔祥熙、王學文的經濟思想。其餘博士生，張遠寫了薛暮橋、苗欣宇寫了陳翰笙、歐陽文和寫了許滌新的經濟思想。碩士生中，童麗寫了章乃器的經濟思想，傅學良寫了陳長蘅等的人口思想。馬濤博士來復旦大學經濟學院任教後，寫了李達的經濟思想。以上各稿除陳長蘅稿外，都經作者的修改和補充。作者還寫了王亞南的經濟思想和總論（後者相當於本冊首章的第1節）。雖然有了這一些，但離目標的完成還有很大的距離。
2005年，孫大權博士被批準進入復旦大學理論經濟學博士後流動站學習和研究中國經濟思想史，作者是他的聯繫導師。2007年出站後留校任教，作者建議他參加《近代中國經濟思想史（下冊）》的撰寫工作。孫大權掌握大量民國時期的經濟學史料，又學習了經濟學基本理論，是繼續完成《近代中國經濟思想史（下冊）》的合適人選。從2005年起，作者受聘為國家《清史·金融篇》的項目主持人，後來又作為《錢法篇》的主審專家，歷時數載，書稿的完成就要依靠孫大權了。他為《近代中國經濟思想史（下冊）》撰寫了首章（第四章）的第二節、第三節，以及馬寅初、劉大鈞、何廉、谷春帆、唐慶增、陳長蘅、翁文灝、董時進、顧翊群、張培剛10人的經濟思想，完成書稿23萬餘字（其中，陳長蘅部分是在傅學良稿基礎上補充修改而成的）。以上稿子的大部分內容已由他寫成論文提交學術會議交流或在學術期刊發表。
以上兩部分書稿是完成下冊稿的基礎。作者在完成《近代中國經濟思想史（下冊）》上冊的定稿以後，就轉而對下冊進行統稿。除重新校對所有的引文外，還對論述的內容作了一些修改和補充。孫大權也參與協助。下冊的研究對像中，有不少人的經濟思想在1949年以後還有新的發展，本冊除介紹研究對像的生平方面不受1949年的限制外，對其經濟思想的介紹和分析一律以1949年10月1日中華人民共和國成立時為下限，其後的經濟思想一般不予涉及。