Benjamin M Neale、Manuel AR Ferreira、
Sarah E Medland、Danielle Posthuma主編，尹先
勇主譯的《遺傳統計學(基於連鎖和關聯分析的基因
定位)》將遺傳學的基礎理論、數理統計學的基本方
法和遺傳學前沿研究結合起來，結構編排科學，主要
包括：遺傳學基礎理論；數理統計學基礎理論；基因
連鎖分析的基礎理論、常用分析方法及其統計模型基
礎、常用分析程序；基因關聯分析的基礎理論、數理
分析方法及其統計模型基礎、常用分析程序。

第—篇 基礎知識
第1章 引言
第2章 DNA和基因分型的基礎
2.1 DNA結構
2.2 DNA重組和遺傳距離
2.3 基因型分析
2.4 基因分型技術
2.5 小結
第3章 群體遺傳學簡介
3.1 歷史背景
3.2 孟德爾遺傳定律
3.3 隨機婚配
3.4 多基因遺傳
3.5 親緣關繫和遺傳共享
3.6 單基因位點的Fisher模型
3.7 多位點和環境效應的Fisher模型
3.8 小結
第4章 統計學基礎
4.1 簡介
4.2 描述性統計量
4.3 統計推斷
4.4 線性回歸
4.5 似然
4.6 混合分布
4.7 小結
第5章 統計把握度
5.1 正確(不正確)決策的概率
5.2 *大似然估計
5.3 小結
5.4 示例
5.5 *小二乘估計
5.6 充分統計量
5.7 小結與局限性
第6章 群體遺傳學及其在基因定位中的作用
6.1 簡介
6.2 哈迪-溫伯格平衡
6.3 遺傳漂變和近親交配
6.4 連鎖不平衡
6.5 小結
第二篇 連鎖分析
第7章 連鎖分析原則
7.1 基因定位
7.2 模型依賴的連鎖分析
7.3 非模型依賴的連鎖分析
7.4 經驗估計全基因組連鎖顯著性
7.5 小結
第8章 IBD估計算法
8.1 簡介
8.2 計算問題：處理未知相型
8.3 家繫數據分析
8.4 舉例
第9章 用於連鎖分析的回歸法
9.1 簡介
9.2 Haseman-Elston算法
9.3 Haseman-Elston算法拓展
9.4 基於回歸的全譜繫連鎖
9.5 模擬研究
9.6 使用MERLIN回歸的幾個實例
9.7 小結
**0章 數量性狀的方差成分連鎖分析
10.1 簡介
10.2 方差成分連鎖模型
10.3 用MERLIN進行方差成分連鎖分析
10.4 結構方程建模軟件包中的方差成分連鎖分析
10.5 小結
**1章 單變量連鎖分析的擴展
11.1 親源效應
11.2 基因型-環境相互作用
11.3 X染色體連鎖
11.4 單因素連鎖分析擴展的實施
**2章 同胞對中多元數據的數量性狀位點檢測
12.1 簡介
12.2 多變量分析在人類遺傳學／雙胞胎研究的簡史
12.3 特征選擇
12.4 多元方差成分連鎖分析
12.5 多元QTL分析：實踐問題
12.6 小結
**3章 連鎖分析中影響**類錯誤和統計把握度的因素
13.1 選擇性抽樣
13.2 樣本量大小
13.3 性狀分布偏差
13.4 異常值
13.5 家繫誤差
13.6 基因分型錯誤
13.7 標記位點的信息性、密度和遺傳圖譜
13.8 質量控制準則
第三篇 關聯研究
**4章 關聯研究概述
14.1 簡介
14.2 關聯研究中的方法
14.3 關聯研究中的概念
14.4 **人類基因組單倍型圖計劃
14.5 關聯研究的把握度
14.6 關聯分析的應用
14.7 小結
**5章 單基因座位關聯模式
15.1 簡介
15.2 基於隨機樣本的關聯分析
15.3 病例-對照研究
15.4 以家繫為基礎的關聯研究
15.5 小結
**6章 全基因組關聯研究數據分析：PLINK使用手冊
16.1 簡介
16.2 GWAS
16.3 GWAS SNP基因分型及數據處理
16.4 分析前的GWAS數據準備
16.5 GWAS數據分析概論
16.6 質量控制
16.7 拷貝數變異
16.8 肌萎縮側索硬化癥病例-對照GWAS數據的描述性分析
16.9 GWAS數據的關聯分析
16.10 PLINK的附加功能
16.11 未來發展方向
16.12 小結
**7章 單倍型分析
17.1 簡介
17.2 人群基礎的單倍型重建
17.3 基於家繫的單倍型構建
17.4 利用單倍型定位疾病基因
17.5 小結
**8章 區域性多位點關聯模型
18.1 簡介及基本方法
18.2 已定相與未定相
18.3 多位點檢驗的使用
18.4 WHAP分析
18.5 小結
**9章 連鎖不平衡與遺傳標記
19.1 連鎖不平衡相關統計量
19.2 基因組的區塊樣特性
19.3 遺傳標記
19.4 群體變異
19.5 復等位基因標記
19.6 小結
第20章 Haploview連鎖不平衡分析和標簽的應用指南
20.1 簡介
20.2 數據檢查
20.3 連鎖不平衡分析
20.4 標簽分析
20.5 在Haploview中查看PLINK結果
20.6 其他的考慮和程序
20.7 小結
第21章 影響關聯分析把握度和**類錯誤的因素
21.1 簡介
21.2 檢測關聯性把握度的影響因素
21.3 人群分層
21.4 基因分型錯誤
21.5 全基因組關聯分析
21.6 發現關聯性的計算把握度
21.7 小結
第22章 統計推斷的重抽樣方法
22.1 簡介
22.2 自助法估計
22.3 置換檢驗
附錄 文件格式
A1.1 概述
A1.2 MERLIN／MERLIN-Regress／Pedstats／Minx／QTDT／GRR
A1.3 WHAP
A1.4 Haploview
A1.5 PLINK
A1.6 DOS與Unix／Linux下運行程序的比較
網絡資源
索引