姚蓉所著的《明末雲間三子研究》分為上、下兩編：上編主要研究雲間三子的生平思想；下編主要研究雲間三子的文學創作。
上編分期討論雲間三子的生平活動，並於他們的種種生平事跡中，探討了他們的人生觀、政治觀、愛情觀等思想觀念的發展變化。
下編將雲間三子的作品分體進行研究，分別敘述他們的文學主張以及詩、詞創作的特征和影響。在論述中，運用雲間三子互相對比以及與同時代其他作家、流派對照的方法，探討他們的文學復古主張的特色和不足，以及它在明代復古文學中的位置，並探討他們的文學創作和時代潮流的關繫，以及對文**流的影響。

緒言
一、研究的緣起
二、研究的歷史回顧
三、研究的思路
上編 雲間三子生平思想研究
第一章 晚明江南士風與文風概述
第一節 晚明江南士風
一、東林清議與江南士風
二、實學思潮與江南士風
三、名士風流與江南士風
第二節 晚明江南文風
一、晚明文**流
二、江南文學傳統
第二章 雲間三子的家世淵源與前期活動
第一節 雲間三子的家世與成長
一、雲間三子的家世淵源
二、雲間三子的定交
第二節 雲間三子的社團活動
一、復社與幾社
二、雲間三子與復社、幾社
第三節 雲間三子與柳如是
一、陳柳、宋柳情事考略
二、陳柳、宋柳情緣再探
第三章 雲間三子的經世情懷與中期活動
第一節 《皇明經世文編》與《農政全書》
一、《皇明經世文編》的編纂
二、《皇明經世文編》的內容
三、《農政全書》的編纂與價值
第二節 雲間三子的政治活動與政治思想
一、雲間三子的政治活動
二、雲間三子的政治思想
第四章 雲間三子的後期活動與生死抉擇
第一節 雲間三子的後期活動
一、甲申之變與雲間三子的政治立場
二、甲申之變後雲間三子的主要經歷
第二節 雲間三子的生死抉擇
一、陳子龍之死與宋征輿之仕
二、陳子龍與李雯之別
第三節 從雲間三子看易代之際士人的人生抉擇
一、殉節與仕清
二、棄諸生與做遺民
下編 雲間三子文學研究
第五章 雲間三子的文學思想
第一節 雲間三子的詩文理論
一、復古論
二、怨刺說
三、創作論
第二節 從明末文壇論爭看雲間三子的文學觀
一、雲間三子與竟陵派
二、雲間三子與唐宋派
三、雲間三子與婁東派、虞山派
四、餘論
第六章 雲間三子的詞
第一節 唱和活動與雲間派詞創作
一、唱和活動與《幽蘭草》、《倡和詩餘》
二、“鬥詞之戲”：雲間詞人唱和活動的特征
第二節 雲間三子詞風之異同
一、題材與主旨
二、意像與造境
第七章 雲間三子的詩
第一節 雲間三子的詩歌內容
一、憂世之作
二、詠懷之作
三、詠情之作
四、山水田園之作
第二節 雲間三子的詩歌風格
一、情感的濃度與力度
二、語言的色彩感
三、詩歌的擬古特色
四、餘論
第八章 雲間三子對清代文學的影響
第一節 雲間三子與雲間派
一、雲間三子與前期雲間派
二、雲間三子與後期雲間派
第二節 雲間三子與清代文壇
一、雲間三子與清代詞壇
二、雲間三子與清代詩壇
附錄：陳子龍交遊考
參考文獻
後記