孫曉勇著的《高通量測序技術在選擇性剪接研究
中的應用》結合生物信息學課題組多年從事選擇性剪
接的研究成果，繫統闡述了高通量技術在選擇性剪接
領域的應用與最新進展，重點講述了分析高通量數據
的軟件，包括通用軟件BioIDMapper、選擇性剪接分
析識別軟件SplicingTypesAnno和nagnag、可視化軟
件prettycloud和pairheatmap。在此基礎上，進一
步探討了通過基因芯片和高通量測序分析挖掘選擇性
剪接的方法和流程，探索性地研究了與編碼區相關的
NAGNAG選擇性剪接、非編碼區相關的未知轉錄本和長
鏈非編碼RNA及相關的調控網絡。最後介紹了反向剪
接產生環形RNA的最新研究成果。
本書以R語言作為主要分析工具，內容新穎，敘
述深入淺出，適用於生物學和生物信息學及其相關專
業的研究者閱讀參考。

前言
第1章 BioIDMapper：生物大分子編碼轉換繫統
1.1 生物大分子編碼轉換
1.2 BioIDMapper下載資源
1.3 繫統要求
1.4 軟件構架
1.5 功能簡介
1.6 圖形用戶界面
1.7 實例
1.8 項目分析
1.9 用戶使用統計
1.10 結論
第2章 SplicingTypesAnno：選擇性剪接識別軟件
2.1 選擇性剪接軟件
2.2 SplicingTypesAnno下載資源
2.3 繫統安裝
2.4 主要剪接類型
2.5 單個基因分析和全轉錄組分析
2.6 輸入輸出格式
2.7 功能描述
2.8 項目分析
2.9 總結報告
2.10 用戶使用統計
2.11 結論
第3章 nagnag：NAGNAG選擇性剪接識別及定量軟件
3.1 NAGNAG選擇性剪接進展
3.2 nagnag下載資源
3.3 輸入輸出格式
3.4 功能描述
3.5 項目分析
3.6 用戶使用統計
3.7 結論
第4章 prettycloud：文本數據的可視化工具
4.1 文本數據的可視化
4.2 prettycloud下載資源
4.3 安裝
4.4 prettycloud算法
4.5 相關參數
4.6 實例
4.7 用戶使用統計
4.8 結論
第5章 pairheatmap：高通量數據可視化工具
5.1 熱圖
5.2 pairheatmap下載資源
5.3 相關參數
5.4 高通量測序數據分析
5.5 用戶使用統計
5.6 結論
第6章 基因芯片分析挖掘表達差異基因
6.1 基因芯片技術