卷之一
陰陽發病六經統論
太陽經綱領
太陽上中下三篇總脈總證
太陽上篇
中風證治第一
中風正治
桂枝湯方
麻黃杏仁甘草石膏湯
太陽壞病
中風失治
五苓散
中風火劫
桂枝加桂湯
中風誤吐
中風誤汗
桂枝加附子湯方
桂枝新加湯方
汗下顛倒
干姜附子湯方
中風誤下
葛根黃連黃芩湯方
桂枝加厚樸杏仁湯方
桂枝去芍藥湯方
桂枝去芍藥加附子湯方
桂枝人參湯方
中風蓄血
桃核承氣湯方
抵當湯方

卷之二
太陽中篇
傷寒證治第二
麻黃湯方
傷寒失治
炙甘草湯方
傷寒禁汗
傷寒誤汗
茯苓甘草湯方
茯苓桂枝甘草大棗湯方
厚樸生姜甘草半夏人參湯方
桂枝甘草湯方
芍藥甘草附子湯方
茯苓四逆湯方
傷寒誤下
梔子豉湯方
梔子厚樸湯方
梔子干姜湯方
梔子甘草豉湯方
梔子生姜豉湯方
茯苓桂枝白術甘草湯方
傷寒蓄血
抵當丸方

卷之三
結胸心下痞髒結附
結胸心下痞發源總論
結胸證治第三
大陷胸湯方
大陷胸丸
小陷胸湯方
文蛤散方
白散方
心下痞證治第四
大黃黃連瀉心湯方
附子瀉心湯方
甘草瀉心湯方
半夏瀉心湯方
生姜瀉心湯方
旋覆代赭石湯方
赤石脂禹餘糧湯方
十棗湯方
瓜蒂散方
附髒結第五
髒結結胸辨論第五

卷之四
太陽篇下
風寒兩傷營衛證治第六
風寒並感證治
大青龍湯方
真武湯方
桂枝二越婢一湯方
桂枝二麻黃一湯方
桂枝去桂加茯苓白術湯方
小建中湯方
風寒火劫
桂枝去芍藥加蜀漆龍骨牡蠣救逆湯方
桂枝甘草龍骨牡蠣湯方
心下水氣
小青龍湯方
證像陽旦
甘草干姜湯方
芍藥甘草湯方
調胃承氣湯方
四逆湯方
邪傳陽明
白虎湯方
白虎加入參湯方

卷之五
溫病風溫痙濕喝
溫病風溫證治第七
附傷寒論無發癍說
痙濕喝三證
痙病證治第八
濕病證治第九
桂枝附子湯方
去桂枝加白術湯，即術附湯
甘草附子湯方
中喝證治第十

卷之六
陽明篇
陽明篇綱領
陽明受病原始
陽明上中下三篇綱領
陽明風寒辨證
陽明上篇
太陽陽明證治第十一
陽明中風
桂枝加葛根湯方
豬苓湯方
中風脾約
蜜煎導法
豬膽導法
麻仁丸方
陽明傷寒
葛根湯方
傷寒脾約
陽明中寒
吳茱萸湯方
大承氣湯方
小承氣湯方
陽明中篇
正陽陽明證治第十二
陽明胃實
陽明發黃
茵陳蒿湯方
梔子柏皮湯方
麻黃連軺赤小豆湯方
陽明蓄血
陽明下篇
少陽陽明證治第十三
少陽陽明

卷之七
少陽全篇合病並病附
少陽證治第十四
少陽正治
小柴胡湯方
少陽傳陰
少陽禁例
少陽壞病
柴胡桂枝干姜湯方
柴胡加桂枝湯
柴胡加龍骨牡蠣湯方
大柴胡湯方
柴胡加芒硝湯方
熱人血室
附合病並病篇
合病並病總論
合病證治第十五
葛根加半夏湯方
黃芩湯方
黃芩加半夏生姜湯即附前方服法內
並病證治第十六

卷之八
太陰篇霍亂附
太陰證治第十七
太陰傷寒
黃連湯方
太陰中風
太陰誤下
桂枝加芍藥湯
桂枝加大黃湯方
附霍亂篇
霍亂證治第十八
霍亂證治
理中丸方

卷之九
少陰篇
少陰前篇證治第十九
少陰見證
少陰禁例
少陰傷寒
麻黃附子細辛湯方
麻黃附子甘草湯方此方當在第六條下
附子湯方
少陰寒利
桃花湯方
通脈四逆湯方
白通湯方
白通加豬膽汁方
少陰後篇證治第二十
少陰中風
少陰禁汗
少陰誤汗
少陰咽痛
甘草湯方
桔梗湯方
半夏散及湯方
苦酒湯方
豬膚湯方
少陰熱厥
四逆散方
少陰熱證
黃連阿膠湯方
少陰急下

卷之十
厥陰篇
厥陰證治第二十一
厥陰傷寒
厥陰中風
厥熱辨論
除中辨論
蛔厥辨論
烏梅丸方
厥陰熱證
厥陰寒證
當歸四逆湯方
當歸四逆加吳茱萸生姜湯方
厥陰誤治
麻黃升麻湯方
干姜黃連黃芩人參湯方
厥陰熱痢
白頭翁湯方
厥陰寒利
寒利回陽
差後諸證證治第二十二
陰陽易
燒裈散方
勞復食復
枳實梔子豉湯
脾胃虛弱
差後發熱
差後水氣
牡蠣澤瀉散方
差後喜唾
差後虛贏
竹葉石膏湯方
方法辨論
銖兩升合古今不同辨論
權量考見《日知錄》
大鬥大兩
三百九十七法一百一十三方辨論附評陶氏謬說
動氣臆說
長沙無朱雀湯說
校注後記