我國的經濟體制改革發端於土地要素市場的改革，城鄉土地市場化改革的不斷深入在經濟社會發展中扮演了至關重要的角色；由於制度環境的變化和制度設計的缺陷，土地市場也成為目前經濟社會矛盾集中的方面之一。土地出讓作為城鄉建設用地入市交易的關鍵環節，土地出讓的制度設計，特別是出讓過程中的收益分配對土地資源的配置效率和出讓過程中的社會公平有著直接的影響，如何通過土地出讓制度改革，建立出讓收益合理共享機制，合理發揮政府和市場的作用，促進土地資源配置中的效率優化和公平改善，已經成為深化改革的迫切要求。
《我國土地出讓制度改革及收益共享機制研究》按照“研究背景一問題剖析和制度分析一經驗比較一解決途徑”的研究主線展開。研究首先繫統總結了現行土地出讓制度及收益分配機制存在的主要問題，即保護資源與保障發展的矛盾日益突出、工業用地擴張迅速且用地效率不高、以經營土地為依托的地方發展模式導致了財政和金融風險的累積、征地過程中土地增值收益分配引發利益衝突和社會風險、土地出讓的政府財政收益支出結構“重硬輕軟”五大方面，進而從制度變遷的內在機制和利益主體間的競爭博弈關繫兩方面對問題的實質及其制度根源進行了深入的理論剖析。
研究認為我國土地出讓制度變遷的內在邏輯是一個土地資源配置市場化程度不斷加強的過程，並在奠定市場經濟體制、提高資源配置效率、保障基礎設施建設等方面發揮了重要功能，但由於土地產權制度、土地征收制度等基本制度的局限，土地市場的發育不足成為土地出讓中存在一繫列問題的根本原因，土地出讓過程中衝突的核心是不同主體間收益分配關繫的變化，改革的重點在於現行制度安排中城鄉土地市場發育明顯滯後的領域，改革的長期方向仍然以效率為基本導向，改革的關鍵是利益格局的重構。
在現行制度安排下，地方政府間的“左右”競爭、中央和地方政府間的“上下”競爭、不同屆政府間的“前後”競爭進一步放大了制度缺陷，扭曲了土地出讓和收益分配機制；城鄉分割的土地市場盡管存在促進鄉村經濟發展、彌補各級地方政府財政收入的正效應，但其對農民土地權益的侵蝕和潛在的效率損失等負效應則要求建立城鄉統一的建設用地市場，市場融合應以增加正效應、減少負效應為原則；農村土地出讓需著眼於不同區域農民獲得感的差異，在不同區域試行差別化的農村土地出讓方式。
通過對上述問題進行經濟解釋和制度分析，研究將改革的重點方向歸結到通過完善稅制結構和財政分配體制優化分稅制改革，從產權、規劃等方面培育農村集體建設用地出讓市場，建立動態、多層次的收益共享機制，完善土地出讓方式和出讓過程管理等方面。在此基礎上，研究從宏觀和微觀層次探討了土地增值收益的形成機理和影響因素，結合對既有土地收益共享理論的比較和評價，研究構建了土地供求雙方以市場談判形成土地收益初次分配格局，政府稅費征收形成土地收益二次分配格局，政府建立生態補償基金、代際補償基金與土地發展基金實現代際代內共享的土地收益共享的實現路徑。
