《證治合參》為清代醫家葉盛所輯，成書於雍正七年（1729），屬綜合性醫書。全書共十八卷。卷一至卷二闡述髒腑、病機、四診、用藥等；卷三至卷十七為內、婦、兒、外科疾病證洽；卷十八彙集食療單方。本次整理以中國中醫科學院藏博古堂據清雍正七年（1729）文蔚堂初刻重印本為底本。

卷之一
五運六氣疏
原病式五運主病
六氣為病
治法大綱
髒氣法時論
十二髒相使貴賤
病機
病機賦
病機抄略
望色論
聞聲論
問病論
切脈論
榮衛論
陰陽論
血氣論
脾胃論
先天後天論
水火陰陽論
辨疑似論
虛實論
五髒六腑脈病虛實例
制方守約論
醫學精微論
用藥宜禁論
五髒補瀉主治例
君臣佐使法
治病必求其本
證治合宜論

卷之二
脈訣
時令脈
脈體捷法
人迎氣口訣
諸病宜忌脈
怪脈
上下來去至止
陰陽大法
陰陽相乘相伏
重陰重陽
脫陰脫陽
脈無根
有力無力
胃氣為本
從證不從脈
從脈不從證
足脈
婦人脈法
小兒脈法
藥性主治指掌
五髒所欲
五髒所苦
手足三陽表裡引經治例
諸藥相反例
用藥法像
四時用藥法
妊娠服藥宜禁例
炮制藥歌

卷之三
內科
中風
類中風
虛勞
脹滿
水腫
膚脹
腸覃
石瘕
噎膈反胃

卷之四
中寒
惡寒
中暑
中濕
燥證
火證
傷寒

卷之五
瘟疫
發熱
惡熱
瘴氣
內傷
傷飲食
郁證
痰飲
咳嗽

卷之六
發喘
短氣
哮吼
失血
溲血
下血
瘧疾
痢疾

卷之七
洩瀉
霍亂
嘔吐
惡心
吞酸
嘈雜
呃逆
暖氣
關格
諸氣
青筋
痞滿
積聚
五疸

卷之八
消渴
痙
痫
癲
狂
眩暈
痺
驚悸
健忘
虛煩
躁
不寐
自汗
盜汗

卷之九
痿
腳氣
厥
赤白濁
遺精
淋
小便不禁
小便不通
大便不通
脫肛

卷之十
補益
心痛
腹痛
脅痛
腰痛
肩背脊臂痛
疝
癘風
破傷風

卷之十一
頭痛
頸項強痛
面痛
耳
鼻
口舌
牙齒
須發
咽喉

卷之十二
眼目
癭瘤
蟲

卷之十三
婦人科
調經
經閉
崩漏
赤白帶下
虛勞

卷之十四
求子
妊娠
產育
產後

卷之十五
幼科
襁褓
乳哺
下胎毒
初生輒死
不能啼
不小便
不大便
重舌
噤風
鵝口
撮口
臍風
臍濕
臍瘡
胎驚
胎痫
胎風
胎黃
驚
慢驚
慢脾風
丹毒
不乳食
吐乳
洩瀉
疳
鶴節
悲哭
龜胸
解顱
囟填
五軟
客忤
中惡
疰病
感冒

卷之十六
痘疹
發熱三朝證治例
發熱三朝決死生例
發熱三朝方藥例
出痘三朝證治例
出痘三朝決死生例
出痘三朝方藥例
起脹三朝證治例
起脹三朝決生死例
起脹三朝方藥例
貫膿三朝證治例
貫膿三朝決生死例
貫膿三朝方藥例
收靨三朝證治例
收靨三朝決生死例
收靨三朝方藥例
痘後餘毒癥治例
痘後餘毒方藥例
痘瘡首尾戒忌例
水痘證治例
麻疹證治例
麻疹方藥例

卷之十七
外科
癰疽
肺癰
疔瘡
瘰疬馬刀
乳癰乳岩
便毒
下疳
痔漏
鶴膝風
臁瘡
楊梅瘡
紫白癜風
跌撲損傷
金瘡
杖瘡
湯火傷
蟲獸傷
中毒
骨鯁

卷之十八
古今治驗食物單方
蔥白
韭菜
大蒜
白菜
芥菜
蘿卜
生姜
芫荽
芹菜
茴香
菠覆
苋菜
萵苣菜
芋艿
山藥
百合
茄子
鼕瓜
胡瓜
絲瓜
木耳
李子
杏子
梅子
桃子
栗子
棗子
秋梨
木瓜
柿子
石榴
橘子
楊梅
白果
檳榔
花椒
胡椒
茶葉
甜瓜
西瓜
葡萄
甘蔗
沙糖
藕
地栗
芝麻
小麥
大麥
荞麥
稻米
黃梁米
粟米
大豆
扁豆
豆豉
豆腐
飴糖
醬
醋
酒
糟
蜂蜜
田雞
鯉魚
鯽魚
烏鯉魚
鰻鱺魚
黃鱔魚
泥鰍
蝦
龜
鱉
黿甲
蟹
牡蠣
蚌
蛤蜊
田螺
螺螄
鵝
鴨
雞
雉
鴿
豬
牛
狗
校注後記

《證治合參》：
嘗聞血屬陰，不足則生熱，斯河間之確論。氣屬陽，有餘便是火，佩丹溪之格言。氣盛者為喘急，為脹滿，為痞塞，兼降火必自已。血虛者為吐衄，為勞瘵，為煩蒸，匪清熱而難痊。
理中湯，治脾胃虛冷；潤下丸，化胸膈痰涎。暴嘔吐逆，為寒所致；久嗽咯血，是火之愆。平胃散，療濕勝濡洩不止；益榮湯，治怔忡恍惚無眠。枳殼散、達生散，令孕婦束胎而易產；麻仁丸、潤腸丸，治老人少血而難便。定驚悸，須索牛黃、琥珀；化蟲積，必仗鶴虱、雷丸。通閉以葵菜、菠薐，取其滑能利竅；消癭以昆布、海藻，因其咸能軟堅。斯先賢之秘妙，啟後進之無傳。
所謂夏傷於暑，秋必作瘧，近而暴者，即時可瘳；遠而痃①音皆者，三日一發。若癉瘧②但用清肌，在陰分勿行截藥。人參養胃，治寒多熱少而虛；柴胡清脾，理熱多寒少而渴。自汗陽虧，盜汗陰弱。嗽而無聲有痰，脾受濕侵；咳而有聲無痰，肺由火鑠。霍亂有寒有暑，何《局方》議乎辛溫。積聚有虛有實，豈世俗偏於峻削。當知木郁可令吐達，金郁洩而土郁奪，水郁折而火郁發。洩發即汗利之稱，折奪乃③攻抑之別。倒倉廩，去陳莝音銼，中州蕩滌良方；開鬼門，潔淨府，上下分消妙法。如斯瞑眩，反掌生殺。輒有一失，悔噬臍之莫追；因而再逆，恥方成之勿約。
大抵暴病非熱，久病非寒。臀背生疽，良由熱積所致；心腹卒痛，卻乃暴寒所干。五洩五疸因濕熱，惟利水為尚；三消三衄為燥火，若滋陰自安。嘔吐呃逆，咎歸於胃；陰癩疝瘕，統屬於肝。液歸心而作汗，斂之者黃芪六一；熱內熾而發疹，消之者人參化斑。身不安兮為躁，心不寧兮為煩。忽然寒僵起粟，昏冒者名為尸厥。卒爾跌僕流涎，時醒者號日癲痫。腹滿吞酸，此是胃中留飲；胸膨噯氣，蓋緣膈上停痰。欲挽回春之力，當修起死之丹。
竊謂陰陽二證，療各不同；內外兩傷，治須審別。內傷外傷，辨口鼻呼吸之情；陰證陽證，察尺寸往來之脈。既明內外陰陽，便知虛實冷熱。日濁日帶，有赤有白，或屬痰而或屬火，白干氣而赤干血。本無寒熱之分，但有虛實之說。痢亦同然。瘀積濕熱，勿行淡滲；兜澀湯丸，可用汗下。寒溫湧洩。導赤散通小便癃閉，溫白丸解大腸痛結。地骨皮散退勞熱偏宜，青礞石丸化結痰甚捷。火郁者必捫其肌，胎死者可驗其舌。玄胡、苦楝，醫寒疝控引於二丸；當歸、龍荟，瀉濕熱痛攻於兩脅。諳曉陰陽虛實之情，便是醫家玄妙之訣。當以諸痛為實，諸癢為虛。虛者精氣不足，實者邪氣有餘。洩瀉有腸垢鹜溏，若滑脫則兜澀為當；腹痛有食積郁熱，倘陰寒則姜附可施。厥心痛者，客寒犯胃；手足溫者，溫散即已；真頭痛者，人連於腦；爪甲黑者，危篤難醫。結陽則肢腫有準，結陰則便血無疑。足壅屈弱日腳氣，腫痛者濕多熱甚；腰痛不已日腎虛，閃挫者氣滯血瘀。巔頂苦痛，藥尊藁本；鼻淵不止，方選辛夷。手麻有濕痰死血，手木緣風濕氣虛。淋瀝似欲通不通，氣虛者清心蓮子，便血審先糞後糞，陰結者平胃地榆。蓋聞溲便不利謂之關，飲食不下謂之格，乃陰陽有所偏乘，故脈息因而覆溢。咳血與嘔血不同，咳血嗽起，嘔血逆來。吞酸與吐酸各別，吞酸刺心，吐酸湧出。水停心下日飲，水積脅下日癖。
……

中醫藥古籍是傳承中華優秀文化的重要載體，也是中醫學傳承數千年的知識寶庫，凝聚著中華民族特有的精神價值、思維方法、生命理論和醫療經驗，不僅對於傳承中醫學術具有重要的歷史價值，更是現代中醫藥科技創新和學術進步的源頭和根基。保護和利用好中醫藥古籍，是弘揚中國優秀傳統文化、傳承中醫學術的必由之路，事關中醫藥事業發展全局。
1949年以來，在政府的大力支持和推動下，開展了繫統的中醫藥古籍整理研究。1958年，國務院科學規劃委員會古籍整理出版規劃小組在北京成立，負責指導全國的古籍整理出版工作。1982年，國務院古籍整理出版規劃小組召開全國古籍整理出版規劃會議，制定了《古籍整理出版規劃（1982-1990）》，衛生部先後下達了兩批200餘種中醫古籍整理任務，掀起了中醫古籍整理研究的新高潮，對中醫文化與學術的弘揚、傳承和發展，發揮了極其重要的作用，產生了不可估量的深遠影響。
2007年《國務院辦公廳關於進一步加強古籍保護工作的意見》明確提出進一步加強古籍整理、出版和研究利用，以及“保護為主、搶救第一、合理利用、加強管理”的方針。2009年《國務院關於扶持和促進中醫藥事業發展的若干意見》指出，要“開展中醫藥古籍普查登記，建立綜合信息數據庫和珍貴古籍名錄，加強整理、出版、研究和利用”。《中醫藥創新發展規劃綱要（2006-2020）》強調繼承與創新並重，推動中醫藥傳承與創新發展。
2003～2010年，國家財政多次立項支持中國中醫科學院開展針對性中醫藥古籍搶救保護工作，在中國中醫科學院圖書館設立全國唯一的行業古籍保護中心，影印搶救瀕危珍本、孤本中醫古籍1640餘種；整理發布《中國中醫古籍總目》；遴選351種孤本收入《中醫古籍孤本大全》影印出版；開展了海外中醫古籍目錄調研和孤本回歸工作，收集了11個國家和2個地區137個圖書館的240餘種書目，基本摸清流失海外的中醫古籍現狀，確定國內失傳的中醫藥古籍共有220種，復制出版海外所藏中醫藥古籍133種。2010年，國家財政部、國家中醫藥管理局設立“中醫藥古籍保護與利用能力建設項目”，資助整理400餘種中醫藥古籍，並著眼於加強中醫藥古籍保護和研究機構建設，培養中醫古籍整理研究的後備人纔，全面提高中醫藥古籍保護與利用能力。