第一章 蛋白質結晶前準備
第一節 目的蛋白質信息檢索與調查
第二節 質粒制備
第三節 蛋白質純化
第四節 蛋白質不表達和包涵體問題
第五節 蛋白質活性鋻定
第六節 蛋白質結晶前分析
第二章 蛋白質結晶與衍射數據收集
第一節 蛋白質結晶
第二節 蛋白質晶體衍射數據收集
第三章 蛋白質晶體結構解析軟件安裝
第一節 Linux繫統安裝
第二節 蛋白質晶體結構解析軟件安裝
第四章 Index、integrate與scale
第一節 一些晶體結構學知識
第二節 蛋白質晶體結構解析流程
第三節 Index和integrate
第四節 Scale
第五節 使用XSCALE功能進行scale
第六節 使用HKL2000進行index、integrate和scale
第五章 分子置換、構建優化與結構提交
第一節 分子置換
第二節 蛋白質晶體結構構建
第三節 蛋白質晶體結構優化
第四節 蛋白質晶體結構驗證
第五節 蛋白質晶體結構提交到PDB
第六章 蛋白質晶體結構展示
第一節 pdb格式文件簡介
第二節 PyMOL制作蛋白質晶體結構圖
第三節 使用PyMOL制作蛋白質配體結合位點的信息
第四節 使用PyMOL調查蛋白質的溫度因子B-factors
第五節 使用PyMOL重疊對比不同的蛋白質晶體結構
第六節 使用PyMOL顯示蛋白質晶體結構中配體的電子密度圖
第七節 PyMOL結合Chimera實現同時顯示非的蛋白質分子
參考文獻