●1傳染病防控與精準醫學
1.1人類對傳染病及其感染病原體的認識從模糊到準確
1.2感染中的病原體確認
1.2.1判斷感染病因
1.2.2條件致病微生物帶來的困惑
1.2.3在微生物組的環境下判斷病原體
1.2.4病原體的診斷標志篩選
1.2.5對病原體的認知進入基因組時代
1.3傳染病暴發疫情需要精準的識別和控制
1.3.1病原體分子分型和基因組分析——精準判別同種病原體中的不同株
1.3.2自不同病例發現相同分子分型特征的病原體——提示可能存在暴發
1.3.3精準的病例定義——增加病例-對照調查中危險因素識別的精準性
1.4流行病學大數據分析發現傳播規律
1.4.1傳染病信息進入大數據時代
1.4.2傳染病發生和傳播數據的收集和分析
1.5疫苗接種群體免疫中的個體化
1.6小結
參考文獻
2傳染病的分子診斷——提高診斷的精準性
2.1多重病原體高通量核酸檢測技術
2.1.1多重PCR技術
2.1.2再測序芯片技術
2.2下一代測序技術
2.2.1短讀長的下一代測序
2.2.2長讀長的下一代測序
2.2.3下一代測序技術的應用
2.3小結
參考文獻
3病原體基因組學——對病原體的深入認識
3.1病原微生物基因組學
3.1.1細菌基因組學的發展歷史
3.1.2細菌基因組學技術
3.1.3細菌基因組學數據庫
3.2微生物基因組的分類學
3.2.1分類學發展史
3.2.2常用基因組分類學方法
3.3分子血清學分型
3.3.1傳統的細菌血清學分型
3.3.2分子生物學技術
3.3.3細菌表面多糖抗原的高度多樣性
3.3.4基因水平的遺傳學多樣性
3.3.5分子血清學分型技術體繫的建立
3.3.6分子血清學分型技術的發展前景
3.4基於基因組分析耐藥
3.4.1細菌耐藥組的定義
3.4.2細菌耐藥組的分類
3.4.3細菌耐藥組的研究手段
3.4.4環境、動物及人體細菌耐藥組
3.4.5細菌耐藥組研究展望
3.5小結
參考文獻
4病原體基因組流行病學——傳染病監測精準化
4.1病原體基因組流行病學分析應用
4.1.1在傳染病監測和暴發調查中應用細菌基因組測序的方法和策略
4.1.2利用病原體基因組序列信息識別暴發
4.1.3追蹤病原體的傳播
4.1.4發現新的傳播模式和途徑
4.1.5鋻別新的克隆群
4.1.6在區域和全球監測網絡中利用微生物基因組監測傳染病
4.2病原體分子分型方法
4.2.1病原體分子分型方法的評價指標
4.2.2病原體分子分型技術
4.3病原體分子分型和基因組學監測應用
4.3.1鼠疫耶爾森菌
4.3.2霍亂弧菌
4.3.3沙門菌
4.3.4致瀉性大腸埃希菌
4.3.5志賀菌
4.3.6小腸結腸炎耶爾森菌與假結核耶爾森菌
4.3.7單增李斯特菌
4.3.8空腸彎曲菌
4.3.9金黃色葡萄球菌
4.3.10豬鏈球菌
4.3.11腦膜炎奈瑟菌
4.3.12軍團菌
4.3.13肺炎克雷伯菌
4.3.14布魯菌
4.3.15伯氏疏螺旋體
4.3.16炭疽杆菌
4.3.17乙型肝炎病毒
4.4基因組流行病分析技術發展趨勢和展望
參考文獻
5傳染病大數據——流行病學監測預警分析應用
5.1大數據定義與特征
5.1.1大數據定義
5.1.2大數據特征
5.1.3傳染病大數據存儲方法和技術
5.1.4傳染病大數據分析技術
5.1.5傳染病大數據預處理技術
5.1.6傳染病數據挖掘技術
5.1.7傳染病熱點發現
5.1.8傳染病可視化分析
5.2基於大數據的傳染病預測預警技術
5.2.1傳染病預警的定義
5.2.2傳染病預警的必要性
5.2.3傳染病預警技術的應用
5.3基於不同數據源的傳染病大數據監測預警繫統
5.3.1基於網絡大數據的傳染病監測預警繫統
5.3.2基於社會因素和自然環境因素大數據分析的傳染病監測預警繫統
5.3.3基於醫療大數據的傳染病監測預警繫統
5.3.4基於病原體監測大數據的傳染病監測預警繫統
5.4大數據的傳染病預測預警繫統
5.4.1結合搜索、社交媒體和傳統監大數據提升流感監測
5.4.2基於傳統疾病監測與搜索、社交媒體和新聞報大數據預測
5.5未來發展趨勢
5.5.1傳大數據的采集和融合技術發展
5.5.2基於大數據的傳染病預測預警新處理技術研發
5.5.3基於大數據的傳染病預測預警新模型研究
5.5.4基於大數據的傳染病預警指標體繫的建立和完善
參考文獻
6疫苗免疫策略制定——準醫學的實踐
6.1疫苗精準免疫的概念
6.2疫苗精準免疫的基本原則
6.2.1基於疫苗特點實現精準免疫
6.2.2基於接種個體特征實現精準免疫
……
7傳染病防控中非藥物干預的優化和精準化
索引
《傳染性疾病與精準預防》為“精準醫學出版工程·精準預防診斷繫列”圖書之一。人類對傳染病的認識和對傳染病的防控能力經歷了從模糊到清晰的過程。隨著基因組學等多種組學、信息化、大數據、學習和分析方法的高度發展，人類對傳染病診斷、預防、控制方面的認知更為深刻，技術更為精準。傳染病的精準預防，實際上是通過利用組學、大數據和分析創新技術，取得更深刻和精準的傳染病防控能力。《傳染性疾病與精準預防》介紹精準醫學理念在傳染病預防方面的發展和應用，重點在傳染病的分子診斷、病原體基因組學的傳染病防控應用、流行病學大數據挖掘利用、精準疫苗預防等方面，介紹基因組學、流行病學大數據的處理方法和應用，將患者、健康人、疾病、病原體、暴發、傳播事件均作為個體，利用大數據深刻認識、區分個體和服務於個性化處置，實現對傳染病控制和預防的精準化。《傳染性疾病與精準預防》適合從事預防醫學、臨床醫學的科研與臨床人員閱讀，也適合高等醫學等
