●卷上 本經上品
1．人參
2．甘草
3．黃芪
4．白術
5．蒼術 附
6．藷蕷
7．石斛
8．酸棗仁
9．大棗
10．芡實
11．蓮實
12．蓮花 附
13．蓮蕊須 附
14．蓮房 附
15．蓮薏 附
16．荷葉 附
17．荷鼻 附
18．薏苡仁
19．仁
20．巨勝子
21．赤箭
22．干地黃
23．麥門鼕
24．天門鼕
25．葳蕤
26．牛膝
27．杜仲
28．枸杞
29．枸杞苗 附
30．地骨皮 附
31．枸杞子 附
32．女貞實
33．五加皮
34．肉苁蓉
35．巴戟天
36．五味子
37．蛇床子
38．覆盆子
39．菟絲子
40．沙參
41．澤瀉
42．菖蒲
43．遠志
44．細辛
45．柴胡
46．升麻
47．桂
48．羌活
49．防風
……
卷中 本經中品
卷下 本經下品

《本草崇原》是一部注釋《神農本草經》的藥學專著。作者張志聰在書中創立了五運六氣之原、明陰陽消長之理的藥氣理論，闡明藥性，解釋詳備，尤其重視格物用藥原則。因此，運氣的觀點是《本草崇原》的特點，也是張氏作此書的成就。當之無愧為《本經》以來首位窺其門徑、登堂入室者。五運六氣、陰陽消長為基礎的藥氣理淪是張氏所倡導的，而氣化、陰陽正是藥物形色氣味的總括，是治病用藥的關鍵，是《本經》核心，也是《本草經典論著十人書》所著重體現和闡釋的。