●引言：HIV研究的突破得益於學科交叉
第1篇 預備知識
第1章 病毒動力學
1.1 導讀：擬合
1.2 HIV感染過程建模
1.2.1 生物背景
1.2.2 半對數圖可以揭示數據的指數關繫
1.2.3 鋻別繫統要素及其主要相互作用是物理建模的第一步
1.2.4 數學分析可以預測一繫列行為
1.2.5 大部分模型都需要用數據擬合
1.2.6 過約束與過擬合
1.3 有關建模的幾句忠告
總結
拓展
習題
第2章 物理學與生物學
2.1 導讀：推斷
2.2 交叉
2.3 量綱分析
總結
習題
第2篇 生物學中的隨機性
第3章 離散型隨機性
3.1 導讀：分布
3.2 隨機性事例
3.2.1 五個典型事例闡明隨機性概念
3.2.2 隨機繫統的計算機模擬
3.2.3 生物和生化的隨機性事例
3.2.4 假像：流行病學中的成簇
3.3 離散型隨機繫統的概率分布
3.3.1 概率分布描述了隨機繫統在什麼程度上是可預測的
3.3.2 隨機變量將數值與樣本空間中的點相關聯
3.3.3 加法規則
3.3.4 減法規則
3.4 條件概率
3.4.1 條件概率是兩概率的比值
3.4.2 獨立事件與乘法規則
3.4.3 嬰兒床死亡事件與檢察官謬論
3.4.4 幾何分布描述一繫列獨立嘗試後獲得成功所需的等待時間
3.4.5 聯合分布
3.4.6 醫學檢查的恰當解釋需要條件概率為前提
3.4.7 貝葉斯公式凝練了條件概率的計算
3.5 期望和矩
3.5.1 期望表達的是隨機變量多次試驗的平均值
3.5.2 隨機變量的方差是其漲落的一種度量
3.5.3 平均值的標準誤差隨樣本數的增加而減小
3.5.4 關聯性和協方差
總結
拓展
習題
第4章 實用離散分布
4.1 導讀：模擬
……
第3篇 反饋控制
第4篇 非線性混沌動力學

《生命繫統的物理建模》源於菲利普·納爾遜（Philip Nelson）教授在賓夕法尼亞大學授課數年的講義，面向的學生主要是2-3年級的理工科學生。不同於先前的生物物理教材往往著眼於介紹生命繫統的物理現像，本書側重於通過物理建模的方式從定量實驗數據中提煉出科學規律，為最終實現生命科學數學化提出了自己的方法。
本書可以用於生物物理學專業的基礎課教學，也適合作為許多其他專業學生拓展知識的優秀讀物，包括物理學、生物學、化學、應用數學等專業。書中部分內容超越了本科範圍，隻要納入教師自己的專業知識，本書同樣很方便作為研究生教材。