●前言 v
撰稿人 ix
第一篇 組學生物信息學基礎
第一章 組學技術、數據和生物信息學原理 3
第二章 組學數據的數據標準：數據共享和重用 31
第三章 組學數據管理和注釋 71
第四章 交叉組學研究項目的數據和知識管理 97
第五章 組學數據的統計分析原理 113
第六章 不同層次組學數據綜合分析的統計方法和模型 133
第七章 時序組學數據集的分析 153
第八章 “組學”術語的恰當使用 173
第二篇 幾種常用組學數據及分析方法
第九章 高通量測序數據的計算分析 199
第十章 對照研究中的單核苷酸多態性分析 219
第十一章 拷貝數變異數據的生物信息學分析 235
第十二章 基於免疫共沉澱的芯片數據處理：從原始圖像生成到分析結果瀏覽 251
第十三章 基於基因表達譜的全局機制分析和疾病相關性 269
第十四章 轉錄組數據的生物信息學分析 299
第十五章 定性和定量蛋白組數據的生物信息學分析 331
第十六章 質譜數據代謝組數據的生物信息學分析 351
第三篇 實用組學生物信息學
第十七章 組掌數據處理過程中的計算分析流程 379
第十八章 組學數據的整合、儲存和分析策略 399
第十九章 信號通路、相互作用網絡構建和功能分析研究中組學數據的整合 415
第二十章 時間依賴型組學數據的網絡推斷 435
第二十一章 組學和文獻挖掘 457
第二十二章 組學和生物信息學在臨床數據處理中的應用 479
第二十三章 基於組學的病理和生理過程分析 499
第二十四章 基於組學的生物標記發現中的數據挖掘方法 511
第二十五章 癌癥靶標識別的綜合生物信息學分析 527
第二十六章 基於組學的分子靶標和生物標記鋻定 547
索引 573

《組學數據生物信息學：研究方法與實驗方案》特邀本領域專業研究人員撰寫，以便向讀者提供一本實用指南。《組學數據生物信息學：研究方法與實驗方案》向讀者展示了一個全新的研究領域——組學數據生物信息學。這一新領域交彙並整合了分子生物學、應用信息學和統計學等不同學科。
《組學數據生物信息學：研究方法與實驗方案》內容十分詳盡，《組學數據生物信息學：研究方法與實驗方案》分為三大部分。首先介紹組學數據的基本分析策略、標準化、管理指南，以及基礎統計學等。接著，按基因組、轉錄組、蛋白質組、代謝組等不同專題介紹各種數據的特定分析策略。最後，以疾病相關生物標記和靶標鋻定等為例，說明組學生物信息學的具體應用。《組學數據生物信息學：研究方法與實驗方案》秉承Springer《分子生物學方法》繫列叢書的一貫風格，闡述明晰、便於使用，各章包括專題簡介、推薦材料、易於操作的實驗方案、疑難問題的注意事項，以及如何避等