●序
前言
第1章 菰屬植物種類分布、起源進化與中國菰遺傳多樣性研究
1.1 菰屬植物種類分布與起源進化
1.2 中國菰的生態與經濟價值
1.3 中國菰遺傳多樣性研究
1.4 中國菰與水稻間的性狀轉移
1.5 總結
參考文獻
第2章 中國菰染色體水平基因組構建與落粒性相關基因分析
2.1 前言
2.2 基因組組裝、錨定和質量評估
2.3 基因組注釋
2.4 中國菰基因組的進化
2.5 中國菰和水稻的基因組與落粒性相關基因共線性分析
2.6 中國菰離層形成和降解的組織學、轉錄組和激素分析
2.7 中國菰和水稻植物卡生生物合成基因簇的共線性分析
2.8 結論
參考文獻
第3章 中國菰米發芽過程中酚類化合物積累機制的研究
3.1 前言
3.2 中國菰米發芽過程
3.3 中國菰米發芽過程中酚含量的變化規律
3.4 中國菰米發芽過程中遊離氨基酸含量的變化規律
3.5 中國菰米發芽過程中蛋白質功能注釋分析
3.6 中國菰米發芽過程中蛋白質表達分析
3.7 中國菰米發芽過程中差異表達蛋白質的GO富集分析
3.8 中國菰米發芽過程中差異表達蛋白質的KEGG富集分析
3.9 中國菰米發芽過程中酚類化合物生物合成關鍵蛋白質表達分析
3.10 中國菰米發芽過程中酚類化合物生物合成關鍵酶基因表達分析
3.11 中國菰米發芽過程中酚類化合物生物合成關鍵酶活性的變化規律
3.12 結論
參考文獻
第4章 中國菰抗病基因ZIBBR/的克隆及功能分析
4.1 前言
4.2 植物材料
4.3 ZlBBR1基因全序列的克隆
4.4 ZlBBR1基因的生物信息學分析
4.5 ZlBBR1基因表達模式分析
4.6 轉ZlBBR1基因水稻的白葉枯病菌PXO71抗性分析
4.7 ZlBBR1互作蛋白的篩選
4.8 ZlBBR1基因的多樣性分析
4.9 常規水稻品種中OsBBR1同源基因的鋻定及進化分析
4.10 結論
參考文獻
第5章 逆境脅迫對茭白幾丁質酶基因ZlChis表達特性及生理活性的影響
5.1 前言
5.2 茭白幾丁質酶基因ZlChis的鋻定
5.3 茭白黑粉菌的分離與驗證
5.4 非生物脅迫對茭白葉片幾丁質酶基因ZlChis表達的影響
5.5 茭白黑粉菌侵染對雄茭葉片幾丁質酶基因ZlChis表達的影響
5.6 茭白黑粉菌侵染對雄茭生理活性的影響
5.7 接種植株的茭白黑粉菌檢測
5.8 結論
參考文獻
第6章 茭白銨轉運蛋白基因ZlAMTs的鋻定及在低氮條件下的表達分析
6.1 前言
6.2 茭白ZlAMTs基因的鋻定與理化性質分析
6.3 茭白ZlAMTs基因的繫統發育分析與基因結構特征
6.4 茭白ZlAMTs蛋白的保守結構域和保守基序分析
6.5 茭白ZlAMTs基因染色體定位和共線性分析
6.6 茭白ZlAMTs基因啟動子區域假定的順式作件分析
6.7 茭白ZlAMTs基因在低氮條件下的表達分析
6.8 結論
參考文獻
第7章 茭白的起源與馴化
7.1 前言
7.2 中國菰和茭白的利用歷史
7.3 中國菰和茭白的遺傳結構
7.4 茭白的起源與馴化
7.5 茭白黑粉菌與茭白栽培品種的多樣性
7.6 結論
參考文獻
第8章 茭白黑粉菌誘導茭白莖發育重編程的轉錄組研究
8.1 前言
8.2 植物材料
8.3 茭白黑粉菌侵染和對照莖的轉錄組組裝、功能富集和差異表達基因
8.4 茭白莖中差異表達基因的表達譜分析
8.5 茭白黑粉菌基因表達譜分析
8.6 茭白莖膨大相關候選基因的鋻定
8.7 細胞分裂素和生長素在茭白膨大莖形成過程中的作用
8.8 茭白膨大莖的表型和茭白黑粉菌的菌株類型有關
8.9 結論
參考文獻
……

《中國菰和茭白基因組學研究》是一部繫統闡述中國菰和茭白基因組學研究進展的專著。內容涉及菰屬植物種類分布、起源進化與中國菰遺傳多樣性研究，中國菰染色體水平基因組構建與落粒性相關基因分析，中國菰米發芽過程中酚類化合物積累機制的研究，中國菰抗病基因ZlBBR1的克隆及功能分析，逆境脅迫對茭白幾丁質酶基因ZlChis表達特性及生理活性的影響，茭白銨轉運蛋白基因ZlAMTs的鋻定及在低氮條件下的表達分析，茭白的起源與馴化，茭白黑粉菌誘導茭白莖發育重編程的轉錄組研究，茭白黑粉菌基因表達導致茭白膨大莖表型的變化，lncRNA在依賴於溫度的茭白莖膨大過程中的作用，轉錄組分析揭示茭白黑粉菌誘導茭白膨大莖形成的共生機制，促進茭白肉質莖起始膨大的生長素來源研究，茭白細胞分信號繫統基因鋻定及其調控茭白莖膨大機制研究。該書是近年來在中國菰和茭白基因組、轉錄組和蛋白質組學等方面近期新科研成果的繫統總結，對從事等