●總說
第一節 問題的提出
第二節 觀念與取向
第三節 做法與釋疑
分說：分科的學史與分科的歷史
第一章 近代中國“文學”源流(1819-1876)
第一節 西人來華與“文學”變義
第二節 中外見聞中的“文學”
第三節 “采西學”議論中的“文學”
結語
第二章 清季學制改革與經學
第一節 經學進入學堂
第二節 經學進入學制的考量
第三節 學制頒布與經學分科
第四節 對於“經學分科”的反應與評議
結語
第三章 中國考古學的形成
第一節 中國上古史的真相
第二節 信史與“文”“物”
第三節 考古學的專門化
第四章 “中國哲學”探源
第一節 “東洋哲學”與“ 哲學”
第二節 泰西哲學與中國固有學問
第三節 “中國哲學”的取向
結語
第五章 中國現代政治學的建立：北京大學政治學科的早期
歷史
第一節 議設京師大學堂：立學宗旨與教學分科
第二節 法政科大學的規劃及設立
第三節 法科改革及其學術化轉向
第四節 現代政治學科的建立
結語
第六章 中國地學會與科學地理的構建(1909-1911)
第一節 興調查植根基
第二節 引入東西詳學理
第三節 洋為中用
第四節 以西學地理繫統條理中學
結語
第七章 中國“文化學”的學科構建
第一節 文化、文明與文化史、文明史
第二節 啟動與倡導：進入學人視野的新領域
第三節 文化論戰對“文化學”的激勵
第四節 建構學科：課程、理論體繫與學術共同體
結語從文化自覺到知識“自覺”
第八章 近代學術的轉承與分合：中山大學人文學科的設置及取向
(1926-1949）
第一節 從國學到史學
第二節 經史致用
第三節 從民俗學到人類學
結語
征引文獻
人名索引
以西學、東學、中學為支點，打破分科治學的局限，不以變化為進化，不以現在為現代，從多學科的角度，用不分科的觀念方法，全面探究近代以來中國的概念、思想、學科、制度轉型的全過程和各層面，溝通古今中外，解析西學與東學對於認識中國歷史文化的格義附會，重建中國自己的話語繫統和條理脈絡，深入認識中華民族新的智能生成運作機制形成的進程、狀態和局限，認識世界一體化進程中東亞文明的別樣性及其對人類發展提供多樣選擇的價值，爭取和保持對於世界文明發展日顯重要的中國歷史文化解釋的主動和主導地位。 今天以前的一切都是歷史，因而歷史本不分科，況且中國治學講究貫通，素來不重分科。可是今日的史學，無非分科的學史和分科的歷史兩種，前者為用各個學科現在的形態追述出來的學科發展史，後者為用不同學科的方法眼界研治的一般或分門別類的歷史。其共同性則是以後出外來的觀念繫統重新組裝歷史。
