《泉州文庫》收錄對像馬有關泉州的專門著作和泉州籍人士（包括長期寓居泉州的有名人物）著作，地域範圍馬泉州一府七縣，即晉江（包括現在的晉江市、石獅市、鯉城區、豐澤區、洛江區）、南安、惠安（包括泉港區）、同安（包括金門縣）、安溪、永春、德化。成書下限為一九四九年九月以前（個別選題酌情下延）。選題內容以文學藝術、歷史、地理、哲學、政治、軍事、科技、語言教育等文化典籍為主，以發掘珍本、孤本為重點，有全國性影響、學術價值高、富有原創性著作優先，兼及零散資料彙總。
《泉州文庫》每種著作盡量收集不同版本進行比較，選擇其中年代較早、內容完整、校刻精的版本為工作底本，並與有關史籍、筆記、文集、叢書參校，文字擇善而從。
《泉州文庫》尊重原著，作者原有注釋與說明文字概予保留。後來增加者，則視其價值取舍。
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