共代謝的作用常常使非生長基質發生結構的轉變，卻不能徹底地將它降解。例如生長在苯甲酸中的微生物能夠氧化3-氯苯甲酸為3-氯鄰苯二酚和4-氯鄰苯二酚，由於氯鄰苯二酚不能繼續作為該微生物環裂解酶的作用基質而稱為終產物。同樣生長在甲苯上的P.putida也能夠共代謝氯苯，生成終端產物氯代鄰苯二酚。因此，要使它徹底轉化，必須有多個菌種的存在。


共代謝中生長基質的選擇是很重要的，許多化合物盡管都可能稱為微生物的生長基質，但誘導產生的酶可能不盡相同。例如，John等人用葡萄糖、甲烷、酚和甲苯富集好氧培養物，並用16種氯代化合物對它們進行了馴化，經馴化後的微生物用於對幾種氯酚的生物轉化進行研究，結果表明用甲苯富集的培養物能夠降解五氯酚和2，4，6-三氯酚，而用葡萄糖、甲烷或酚富集的培養物對它們表現出很少甚至沒有活性，而用酚和甲苯混合物富集的培養物卻能迅速降解2，4-二氯酚，不能降解2，6-二氯酚或2，4，5-三氯酚。一般來說，生長基質與非生長基質在分子骨架結構類似時，生長基質誘導的酶很可能非專一性地共代謝非生長基質。


綜上所述，許多氯代芳香化合物不能直接被微生物作為生長基質，但是它可通過共代謝改變其結構而容易為其他微生物所降解。事實上，環境中許多難降解有毒化合物的轉化都是通過共代謝來完成的。因此，為了解某一種難降解有機物，可以利用一種合適的生長基質的存在來誘導所需的酶一級產生足夠的能量來驅動難降解有機物的初轉化。


共代謝廣泛存在於共基質的降解過程中，作為一種代謝機制，不僅有助於更加準確地認識環境中存在的共代謝情況下物質的生物降解，而且為尋求難降解有機物的生物降解技術提供了新的思路。


五、培養基的分類

無論是富集培養還是純種分離，都要涉及到培養基的配置。配置培養基有四個基本原’則：目的明確、營養協調、理化條件適宜、經濟節約。對於石油化工環境中的微生物而言，無論是用來修復受石油污染的環境，還是免除石油開采過程中有害微生物的影響，都需要在培養基的配置過程中模擬原生態環境，使篩選出來的菌種更容易適應，有更好的降解效果，或者較全面地分離到石化環境中的有害微生物。此外，石化環境中的微生物研究目前仍有很大未知部分，在設計培養基的時候，還要廣泛查閱文獻，並結合實際研究點進行各種試驗研究，精心設計，確定培養基營養及其成分配比、理化條件。在實際應用中，受污染的環境由於其地理位置、氣候、土壤特性、植被等的不同而有一定差異。在石油開采中，貯藏地點、條件原油類型不同也會影響到微生物種類，因此模擬原生環境通過試驗對比精心設計並選擇培養基有很重要的意義。


微生物種類不同，所需培養基不同；同一菌種用於不同使用目的時，對培養基的要求也不一樣，形成不同類型的培養基。幾種常用培養基的組成見表2-4。


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