為評估國家重點生態功能區財政轉移支付的生態環境保護效果,環保部、財政部於2009年啟動了國家重點生態功能區縣域生態環境質量考核評價工作。通過近三年的技術準備,目前已基本建立國家重點生態功能區縣域生態環境質量考核的工作機制和技術體繫,並於2012年研發了縣級數據填報、省級數據審核以及國家數據分析評價及綜合管理多層次多目標的軟件繫統,提高了該項工作的規範化、標準化、信息化和自動化水平。
羅毅、陳斌主編的《國家重點生態功能區縣域生態環境質量考核工作手冊》整理了國家重點生態功能區縣域生態環境質量考核工作相關的文件、技術方案、技術指南以及軟件使用手冊,方便參與國家重點生態功能區縣域生態環境質量考核工作的管理及技術人員使用。