借“南澳I號”水下考古之際,考古隊通過對南澳海洋文化遺存的全面調查,形成了本書稿的主要內容。本書從南澳島的實物調查資料入手,對閩越兩省現存明清海防城堡遺存、明清海岸煙墩、炮臺要塞、水師、民防或海盜營寨遺址,船官、船政史跡、海防官兵墓葬進行整理。囊括南澳島上大部分海疆與海防文化遺產,從物質文化遺產角度展示了南澳島的海疆經略與海防史,為以後更多的海島考古學調查與研究奠定了基礎。在理論方法上,本書重新梳理了海洋考古學的相關概念,及國內海洋考古學的發展現狀,並以聚落考古為著眼點,探討了對海洋聚落的理論探索和實踐。