《閻崇年史學論集》收錄作者在清史、北京史、滿學研究方面的成果。《清史卷》三冊,卷上主要包括作者對於清代幾個貫通性問題的綜論,涉及滿洲勃興的東北地域文化、清朝對全國的統治、清代的歷史大勢以及清代的法制問題。此外,還涉及明清易代之際的幾個重要戰役、滿洲對東北地域的征伐以及順治即位問題的考釋。卷中主要圍繞兩個歷史人物展開——努爾哈赤與袁崇煥,這也是作者多年關注的兩個人物,由研究這兩個人,進而研究明亡清興的歷史。卷下的內容主要以清入關為大的背景,其中主要篇幅是對康熙朝歷史的多角度關注,旁及一些歷史人物的研究。